EDB [Session M. Adam/[宇野好宣]/Kwon Taejoon/Chapman A. Jarrod/Toyoda Atsushi/Takahashi Shuji/Fukui Akimasa/Hikosaka Akira/Suzuki Atsushi/Kondo Mariko/van Heeringen J. Simon/Quigley Ian/Heinz Sven/Ogino Hajime/Ochi Haruki/Hellsten Uffe/Lyons B. Jessica/Simakov Oleg/Putnam Nicholas/Stites Jonathan/Kuroki Yoko/Tanaka Toshiaki/Michiue Tatsuo/[渡部稔]/Bogdanovic Ozren/Lister Ryan/Georgiou Georgios/Paranjpe S. Sarita/van Kruijsbergen Ila/Shu Shengquiang/Carlson Joseph/Kinoshita Tsutomu/Ohta Yuko/Mawaribuchi Shuuji/Jenkins Jerry/Grimwood Jane/Schmutz Jeremy/Mitros Therese/Mozaffari V. Sahar/Suzuki Yutaka/Haramoto Yoshikazu/Yamamoto S. Takamasa/Takagi Chiyo/Heald Rebecca/Miller Kelly/Haudenschild Christian/Kitzman Jacob/Nakayama Takuya/Izutsu Yumi/Robert Jacques/Fortriede Joshua/Burns Kevin/Lotay Vaneet/Karimi Kamran/Yasuoka Yuuri/Dichmann S. Darwin/Flajnik F. Martin/Houston W. Douglas/Shendure Jay/DuPasquier Louis/Vize D. Peter/Zorn M. Aaron/Ito Michihiko/Marcotte M. Edward/Wallingford B. John/Ito Yuzuru/Asashima Makoto/Ueno Naoto/Matsuda Yoichi/Veenstra Jan C. Gert/Fujiyama Asao/Harland M. Richard/Taira Masanori/Rokhsar S. Daniel/Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis./[Nature]] (329727)

『徳島大学教育・研究者情報データベース (EDB)』---[学外] /

〔閲覧〕【著作】（Session M. Adam/[宇野好宣]/Kwon Taejoon/Chapman A. Jarrod/Toyoda Atsushi/Takahashi Shuji/Fukui Akimasa/Hikosaka Akira/Suzuki Atsushi/Kondo Mariko/van Heeringen J. Simon/Quigley Ian/Heinz Sven/Ogino Hajime/Ochi Haruki/Hellsten Uffe/Lyons B. Jessica/Simakov Oleg/Putnam Nicholas/Stites Jonathan/Kuroki Yoko/Tanaka Toshiaki/Michiue Tatsuo/[渡部稔]/Bogdanovic Ozren/Lister Ryan/Georgiou Georgios/Paranjpe S. Sarita/van Kruijsbergen Ila/Shu Shengquiang/Carlson Joseph/Kinoshita Tsutomu/Ohta Yuko/Mawaribuchi Shuuji/Jenkins Jerry/Grimwood Jane/Schmutz Jeremy/Mitros Therese/Mozaffari V. Sahar/Suzuki Yutaka/Haramoto Yoshikazu/Yamamoto S. Takamasa/Takagi Chiyo/Heald Rebecca/Miller Kelly/Haudenschild Christian/Kitzman Jacob/Nakayama Takuya/Izutsu Yumi/Robert Jacques/Fortriede Joshua/Burns Kevin/Lotay Vaneet/Karimi Kamran/Yasuoka Yuuri/Dichmann S. Darwin/Flajnik F. Martin/Houston W. Douglas/Shendure Jay/DuPasquier Louis/Vize D. Peter/Zorn M. Aaron/Ito Michihiko/Marcotte M. Edward/Wallingford B. John/Ito Yuzuru/Asashima Makoto/Ueno Naoto/Matsuda Yoichi/Veenstra Jan C. Gert/Fujiyama Asao/Harland M. Richard/Taira Masanori/Rokhsar S. Daniel/Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis./[Nature]）

登録内容 (EID=329727)

EID=329727

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○種別 (必須):

□

学術論文 (審査論文)

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○言語 (必須):

□

英語

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○招待 (推奨):

○審査 (推奨):

○カテゴリ (推奨):

○共著種別 (推奨):

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国際共著 (徳島大学内研究者と国外研究機関所属研究者との共同研究)

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○学究種別 (推奨):

○組織 (推奨):

○著者 (必須):

(英) Session M. Adam (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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宇野好宣 ([徳島大学.大学院社会産業理工学研究部.理工学域.自然科学系.生物科学分野])

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(英) Kwon Taejoon (日) (読)

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(英) Chapman A. Jarrod (日) (読)

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(英) Toyoda Atsushi (日) (読)

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(英) Takahashi Shuji (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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(英) Fukui Akimasa (日) (読)

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(英) Hikosaka Akira (日) (読)

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(英) Suzuki Atsushi (日) (読)

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10.

(英) Kondo Mariko (日) (読)

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11.

(英) van Heeringen J. Simon (日) (読)

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12.

(英) Quigley Ian (日) (読)

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13.

(英) Heinz Sven (日) (読)

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14.

(英) Ogino Hajime (日) (読)

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15.

(英) Ochi Haruki (日) (読)

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16.

(英) Hellsten Uffe (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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17.

(英) Lyons B. Jessica (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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18.

(英) Simakov Oleg (日) (読)

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19.

(英) Putnam Nicholas (日) (読)

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20.

(英) Stites Jonathan (日) (読)

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21.

(英) Kuroki Yoko (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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22.

(英) Tanaka Toshiaki (日) (読)

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23.

(英) Michiue Tatsuo (日) (読)

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24.

渡部稔 ([徳島大学.教養教育院])

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25.

(英) Bogdanovic Ozren (日) (読)

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26.

(英) Lister Ryan (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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27.

(英) Georgiou Georgios (日) (読)

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28.

(英) Paranjpe S. Sarita (日) (読)

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29.

(英) van Kruijsbergen Ila (日) (読)

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30.

(英) Shu Shengquiang (日) (読)

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31.

(英) Carlson Joseph (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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32.

(英) Kinoshita Tsutomu (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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33.

(英) Ohta Yuko (日) (読)

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34.

(英) Mawaribuchi Shuuji (日) (読)

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35.

(英) Jenkins Jerry (日) (読)

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36.

(英) Grimwood Jane (日) (読)

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37.

(英) Schmutz Jeremy (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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38.

(英) Mitros Therese (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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39.

(英) Mozaffari V. Sahar (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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40.

(英) Suzuki Yutaka (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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41.

(英) Haramoto Yoshikazu (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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42.

(英) Yamamoto S. Takamasa (日) (読)

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43.

(英) Takagi Chiyo (日) (読)

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44.

(英) Heald Rebecca (日) (読)

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45.

(英) Miller Kelly (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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46.

(英) Haudenschild Christian (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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47.

(英) Kitzman Jacob (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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48.

(英) Nakayama Takuya (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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49.

(英) Izutsu Yumi (日) (読)

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50.

(英) Robert Jacques (日) (読)

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51.

(英) Fortriede Joshua (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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52.

(英) Burns Kevin (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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53.

(英) Lotay Vaneet (日) (読)

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54.

(英) Karimi Kamran (日) (読)

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55.

(英) Yasuoka Yuuri (日) (読)

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56.

(英) Dichmann S. Darwin (日) (読)

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57.

(英) Flajnik F. Martin (日) (読)

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58.

(英) Houston W. Douglas (日) (読)

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59.

(英) Shendure Jay (日) (読)

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60.

(英) DuPasquier Louis (日) (読)

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61.

(英) Vize D. Peter (日) (読)

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62.

(英) Zorn M. Aaron (日) (読)

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63.

(英) Ito Michihiko (日) (読)

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64.

(英) Marcotte M. Edward (日) (読)

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65.

(英) Wallingford B. John (日) (読)

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66.

(英) Ito Yuzuru (日) (読)

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67.

(英) Asashima Makoto (日) (読)

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68.

(英) Ueno Naoto (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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69.

(英) Matsuda Yoichi (日) (読)

○役割 (任意):

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○学籍番号 (推奨):

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70.

(英) Veenstra Jan C. Gert (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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71.

(英) Fujiyama Asao (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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72.

(英) Harland M. Richard (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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73.

(英) Taira Masanori (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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74.

(英) Rokhsar S. Daniel (日) (読)

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○学籍番号 (推奨):

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○題名 (必須):

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(英) Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis. (日)

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○副題 (任意):

○要約 (任意):

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(英) To explore the origins and consequences of tetraploidy in the African clawed frog, we sequenced the Xenopus laevis genome and compared it to the related diploid X. tropicalis genome. We characterize the allotetraploid origin of X. laevis by partitioning its genome into two homoeologous subgenomes, marked by distinct families of 'fossil' transposable elements. On the basis of the activity of these elements and the age of hundreds of unitary pseudogenes, we estimate that the two diploid progenitor species diverged around 34 million years ago (Ma) and combined to form an allotetraploid around 17-18 Ma. More than 56% of all genes were retained in two homoeologous copies. Protein function, gene expression, and the amount of conserved flanking sequence all correlate with retention rates. The subgenomes have evolved asymmetrically, with one chromosome set more often preserving the ancestral state and the other experiencing more gene loss, deletion, rearrangement, and reduced gene expression. (日)

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○キーワード (推奨):

アフリカツメガエル (Xenopus laevis)

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ゲノム (genome)

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染色体 (chromosome)

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異質四倍体 (allotetraploid)

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○発行所 (推奨):

○誌名 (必須):

□

Nature ([Nature Publishing Group])

(pISSN: 0028-0836, eISSN: 1476-4687)

○ISSN (任意):

□

1476-4687

ISSN: 0028-0836 (pISSN: 0028-0836, eISSN: 1476-4687)
Title: Nature
Title(ISO): Nature
Publisher: Nature Portfolio
(NLM Catalog) (Scopus) (CrossRef) (Scopus information is found. [need login])

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○巻 (必須):

□

538

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○号 (必須):

□

7625

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○頁 (必須):

□

336 343

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○都市 (任意):

○年月日 (必須):

□

西暦 2016年 10月 20日 (平成 28年 10月 20日)

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○URL (任意):

○DOI (任意):

□

10.1038/nature19840 (→Scopusで検索)

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○PMID (任意):

□

27762356 (→Scopusで検索)

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○CRID (任意):

○Scopus (任意):

2-s2.0-84992376574

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○機関リポジトリ :

□

110155

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○researchmap (任意):

○評価値 (任意):

○被引用数 (任意):

○指導教員 (推奨):

○備考 (任意):

(英) Article.ELocationID: 10.1038/nature19840 (日)

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(英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Comparative Study (日)

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(英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article (日)

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(英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Research Support, N.I.H., Extramural (日)

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(英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Research Support, Non-U.S. Gov't (日)

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(英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Research Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S. (日)

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標準的な表示

和文冊子 ●

Adam M. Session, Yoshinobu Uno, Taejoon Kwon, Jarrod A. Chapman, Atsushi Toyoda, Shuji Takahashi, Akimasa Fukui, Akira Hikosaka, Atsushi Suzuki, Mariko Kondo, Simon Heeringen J. van, Ian Quigley, Sven Heinz, Hajime Ogino, Haruki Ochi, Uffe Hellsten, Jessica B. Lyons, Oleg Simakov, Nicholas Putnam, Jonathan Stites, Yoko Kuroki, Toshiaki Tanaka, Tatsuo Michiue, Minoru Watanabe, Ozren Bogdanovic, Ryan Lister, Georgios Georgiou, Sarita S. Paranjpe, Ila Kruijsbergen van, Shengquiang Shu, Joseph Carlson, Tsutomu Kinoshita, Yuko Ohta, Shuuji Mawaribuchi, Jerry Jenkins, Jane Grimwood, Jeremy Schmutz, Therese Mitros, Sahar V. Mozaffari, Yutaka Suzuki, Yoshikazu Haramoto, Takamasa S. Yamamoto, Chiyo Takagi, Rebecca Heald, Kelly Miller, Christian Haudenschild, Jacob Kitzman, Takuya Nakayama, Yumi Izutsu, Jacques Robert, Joshua Fortriede, Kevin Burns, Vaneet Lotay, Kamran Karimi, Yuuri Yasuoka, Darwin S. Dichmann, Martin F. Flajnik, Douglas W. Houston, Jay Shendure, Louis DuPasquier, Peter D. Vize, Aaron M. Zorn, Michihiko Ito, Edward M. Marcotte, John B. Wallingford, Yuzuru Ito, Makoto Asashima, Naoto Ueno, Yoichi Matsuda, Gert Jan C. Veenstra, Asao Fujiyama, Richard M. Harland, Masanori Taira and Daniel S. Rokhsar : Genome evolution in the allotetraploid frog Xenopus laevis., Nature, 538, 7625, 336-343, 2016.

欧文冊子 ●

登録内容 (EID=329727)

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