| ○種別 (必須): | □ | 学術論文 (審査論文)
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| ○言語 (必須): | □ | 英語
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| ○招待 (推奨): |
| ○審査 (推奨): | □ | Peer Review
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| ○カテゴリ (推奨): | □ | 研究
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| ○共著種別 (推奨): | □ | 国際共著 (徳島大学内研究者と国外研究機関所属研究者との共同研究)
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| ○学究種別 (推奨): |
| ○組織 (推奨): | 1. | 徳島大学.理工学部.理工学科.知能情報コース.情報工学講座 (2016年4月1日〜)
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| ○著者 (必須): | 1. | (英) Wang, Xiaohua (日) (読)
| ○役割 (任意): |
| ○貢献度 (任意): |
| ○学籍番号 (推奨): |
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| 2. | (英) Liu, Xinyue (日) (読)
| ○役割 (任意): |
| ○貢献度 (任意): |
| ○学籍番号 (推奨): |
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| 3. | (英) Li, Lingyun (日) (読)
| ○役割 (任意): |
| ○貢献度 (任意): |
| ○学籍番号 (推奨): |
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| 4. | (英) Zhang, Fuming (日) (読)
| ○役割 (任意): |
| ○貢献度 (任意): |
| ○学籍番号 (推奨): |
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| 5. | (英) Hu, MIn (日) (読)
| ○役割 (任意): |
| ○貢献度 (任意): |
| ○学籍番号 (推奨): |
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| 6. | 任 福継 (->個人[中川 福継])
| ○役割 (任意): |
| ○貢献度 (任意): |
| ○学籍番号 (推奨): |
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| ○題名 (必須): | □ | (英) GlycCompSoft: Software for Automated Comparison of Low Molecular Weight Heparins Using Top-Down LC/MS Data (日) トップダウンLC / MSデータを用いた低分子ヘパリンの自動比較ソフトウェア
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| ○副題 (任意): |
| ○要約 (任意): | □ | (英) Low molecular weight heparins are complex polycomponent drugs that have recently become amenable to top-down analysis using liquid chromatography-mass spectrometry. Even using open source deconvolution software, DeconTools, and automatic structural assignment software, GlycReSoft, the comparison of two or more low molecular weight heparins is extremely time-consuming, taking about a week for an expert analyst and provides no guarantee of accuracy. Efficient data processing tools are required to improve analysis. This study uses the programming language of Microsoft Excel™ Visual Basic for Applications to extend its standard functionality for macro functions and specific mathematical modules for mass spectrometric data processing. The program developed enables the comparison of top-down analytical glycomics data on two or more low molecular weight heparins. The current study describes a new program, GlycCompSoft, which has a low error rate with good time efficiency in the automatic processing of large data sets. The experimental results based on three lots of Lovenox®, Clexane® and three generic enoxaparin samples show that the run time of GlycCompSoft decreases from 11 to 2 seconds when the data processed decreases from 18000 to 1500 rows. (日) 低分子量ヘパリンは，最近，液体クロマトグラフィー - 質量分析を用いたトップダウン分析に従順になった複雑なポリ成分薬物である．オープンソースのデコンボリューションソフトウェア，DeconTools，自動構造割り当てソフトウェア，GlycReSoftを使用しても，2つ以上の低分子量ヘパリンの比較には非常に時間がかかり，熟練したアナリストにとっては約1週間かかる．この研究では，マクロ機能用の標準機能と質量分析データ処理用の特定の数学モジュールを拡張している．開発されたプログラムは，2つ以上の低分子量ヘパリンについてのトップダウン分析グリコックスデータの比較を可能にする．
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| ○キーワード (推奨): | 1. | (英) (日) 俗語 (読)
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| 2. | (英) (日) トピック分析 (読)
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| 3. | (英) (日) 時系列分析 (読)
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| ○発行所 (推奨): | □ | (英) PLOS ONE (日) (読)
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| ○誌名 (必須): | □ | PLoS ONE (Public Library of Science)
(eISSN: 1932-6203)
| ○ISSN (任意): | □ | 1932-6203
ISSN: 1932-6203
(eISSN: 1932-6203) Title: PloS oneTitle(ISO): PLoS OnePublisher: PLOS (NLM Catalog)
(Scopus)
(CrossRef)
(Scopus information is found. [need login]) | [継承] |
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| ○巻 (必須): | □ | 11
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| ○号 (必須): | □ | 12
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| ○頁 (必須): | □ |
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| ○都市 (任意): |
| ○年月日 (必須): | □ | 西暦 2016年 12月 12日 (平成 28年 12月 12日)
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| ○URL (任意): | □ | http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0167727
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| ○DOI (任意): | □ | 10.1371/journal.pone.0167727 (→Scopusで検索)
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| ○PMID (任意): | □ | 27942011 (→Scopusで検索)
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| ○CRID (任意): |
| ○WOS : | □ | 000392745600027
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| ○Scopus (任意): | 1. | 2-s2.0-85006251852
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| ○機関リポジトリ : | □ | 112311
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| ○researchmap (任意): |
| ○評価値 (任意): |
| ○被引用数 (任意): |
| ○指導教員 (推奨): |
| ○備考 (任意): | 1. | (英) Article.ELocationID: 10.1371/journal.pone.0167727 (日)
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| 2. | (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article (日)
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| 3. | (英) CoiStatement: The authors have no competing interests. (日)
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