『徳島大学 教育・研究者情報データベース (EDB)』---[学外] /
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登録内容 (EID=216663)

EID=216663EID:216663, Map:[2010/細胞生理学特論], LastModified:2011年1月21日(金) 22:39:02, Operator:[中村 嘉利], Avail:TRUE, Censor:0, Owner:[[教務委員会委員]/[徳島大学.工学部.生物工学科]], Read:継承, Write:継承, Delete:継承.
種別 (必須): 先端技術科学教育部 (授業概要) [継承]
入学年度 (必須): 西暦 2011年 (平成 23年) [継承]
名称 (必須): (英) Advamced Cell Physiology (日) 細胞生理学特論 (読) さいぼうせいりがくとくろん
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形態 (推奨): 1.ポートフォーリオ [継承]
コース (必須): 1.2011/[環境創生工学専攻.生命テクノサイエンスコース]/[博士前期課程] [継承]
担当教員 (必須): 1.中村 嘉利 ([徳島大学.大学院社会産業理工学研究部.生物資源産業学域.応用生命系.応用生物資源学分野]/[徳島大学.生物資源産業学部.生物資源産業学科.応用生命講座])
肩書 (任意):
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単位 (必須): 2 [継承]
目的 (必須): (英) This class is intended to demonstrate how to use capable molecular viewers (PyMol & Coot) for protein structure, which can be used for detailed analyses of protein 3D-structure.  (日) 立体構造解析されたタンパク質を詳細に分析,観察できるviewerプログラムをマスターする.   [継承]
概要 (必須): (英) This class (portfolio) introduces how the programs (PyMol & Coot) can be used, and what their capabilities are.  (日) プログラムとしてPyMolとCootを取り上げ,これらの使用法とどのような分析,観察が可能か解説する.授業の形式はポートフォーリオ形式とする.   [継承]
キーワード (推奨): 1. (英) protein 3D-structure (日) タンパク質立体構造 (読) [継承]
2. (英) protein data bank (日) プロテインデータバンク (読) [継承]
3. (英) PyMol (日) パイモル (読) [継承]
4. (英) Coot (日) クート (読) [継承]
先行科目 (推奨):
関連科目 (推奨): 1.生体高分子化学特論 ([2011/[環境創生工学専攻.生命テクノサイエンスコース]/[博士前期課程]]/->授業概要[2010/生体高分子化学特論])
関連度 (任意):
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要件 (任意): (英) Students are required to bring note-type PC, if necessary (Windows is better).  (日) 必要な場合はノート型パソコンを用意すること(Windows が望ましい).   [継承]
注意 (任意):
目標 (必須): 1.(英) To understand protein coordinate file.  (日) タンパク質の座標ファイルを利用·編集できる.レポートで評価  
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2.(英) To understand operation of molecular viewers.  (日) viewerプログラムをマスターする.レポートで評価  
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計画 (必須): 1.(英) Protein Data Bank and coodinate file  (日) プロテインデータバンクと座標ファイル  
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2.(英) Installation of the programs  (日) プログラムのインストール  
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3.(英) Getting started with mouse controls  (日) マウスコントロール  
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4.(英) Getting started with commands  (日) コマンドライン入力  
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5.(英) Comand syntax  (日) コマンドの構文  
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6.(英) Atom selection  (日) 原子セレクト  
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7.(英) Ray-tracing and stereo  (日) レイトレーシングとステレオ図  
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8.(英) Animation  (日) 動画  
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9.(英) Tutorial 1:basics  (日) チュートリアル 1:基礎  
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10.(英) Tutorial 2:advanced techniques  (日) チュートリアル 2:応用  
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11.(英) Tutorial 3:example scripts  (日) チュートリアル 3:スクリプトの例  
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12.(英) Exercise 1:editing of PDB file  (日) 演習 1:PDBファイルの編集  
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13.(英) Exercise 2:structural comparison  (日) 演習 2:構造比較  
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14.(英) Exercise 3:DALI web server  (日) 演習 3:DALIサーバー  
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15.(英) Exercise 4: WHAT IF web server  (日) 演習 4:WHAT IFサーバー  
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評価 (必須): (英) Drawing products with brief explanation (assignments count 100%)  (日) 最後に提出するレポートで評価する(100%).   [継承]
再評価 (必須):
対象学生 (任意): 開講コース学生のみ履修可能 [継承]
教科書 (必須): 1.(英) To be introduced in the class  (日) 授業中に紹介する   [継承]
参考資料 (推奨): 1.(英) To be introduced in the class  (日) 授業中に紹介する   [継承]
URL (任意):
連絡先 (推奨): 1. (英) Administration Office(M703) (日) 生物事務室(M棟703) (読)
オフィスアワー (任意):
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科目コード (推奨):
備考 (任意): 1.(英) When you take this class, it is necessary to do preparation for 2h and review for 2h everry 2h class for your understanding and taking credit.  (日) 授業を受ける際には,2時間の授業時間毎に2時間の予習と2時間の復習をしたうえで授業を受けることが,授業の理解と単位取得のために必要である.   [継承]
2.(英)   (日) 成績評価に対する平常点と試験の比率は50:50とする.平常点には講義への参加状況,演習への回答及びレポートの提出状況と内容を含み,試験は中間テストと最終試験の成績を含む.   [継承]

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