徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: [片岡 正俊]/Inoue Sonoko/Kajimoto Kazuaki/[篠原 康雄]/[馬場 嘉信]/Usefulness of microchip electrophoresis for reliable analyses of non-satndard DNA samples and subsequent on-chip enzymatic digestion/[European Journal of Biochemistry]

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EID
96871
EOID
676211
Map
0
LastModified
2013年1月22日(火) 13:10:03
Operator
松井 栄里
Avail
TRUE
Censor
承認済
Owner
篠原 康雄
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Write
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継承
種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨 Peer Review
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
  1. 徳島大学.ゲノム機能研究センター(〜2008年3月31日/->組織[徳島大学.疾患プロテオゲノム研究センター])
著者 必須
  1. 片岡 正俊
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Inoue Sonoko
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. (英) Kajimoto Kazuaki
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. 篠原 康雄([徳島大学.先端酵素学研究所.基幹研究部門])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. 馬場 嘉信
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Usefulness of microchip electrophoresis for reliable analyses of non-satndard DNA samples and subsequent on-chip enzymatic digestion

副題 任意
要約 任意

(英) The Hitachi SV1100 utilizes capillary electrophoresis on a microchip that is capable of rapidly sizing DNA fragments. Reproducibility of electrophoresis in different channels was shown by comparing the migration times of the internal controls, DNA fragments of 100 and 800 bp. The range of DNA sizing for this microchip is between 100 and 800 bp, and accuracy in sizing of a 322 bp DNA fragment of a pUC118 PvuII digest was observed, independent of DNA concentration. Although relatively good quantification of this fragment was observed with a DNA concentration of 1.83 ng.microL(-1), error increased in a dose-dependent manner. Furthermore, the feasibility of sequential analysis with this microchip was shown by the reproducibility of successive electrophoreses of the internal control in one channel. When the pUC118 PvuII digest was treated with endonuclease KpnI on the microchip for 10 min, sequential analysis showed that the 322 bp fragment completely disappeared and two peaks corresponding to the 130 and 192 bp fragments appeared. This analysis was performed within 4 min, and the peaks were estimated as 127 and 183 bp, respectively. These results indicate the potential of on-microchip endonuclease treatment of plasmid DNA with sequential analysis, offering high resolution in a short time.

キーワード 推奨
  1. (英) DNA
  2. (英) Deoxyribonucleases, Type II Site-Specific
  3. (英) Electrophoresis, Capillary
  4. (英) Plasmids
  5. (英) Reproducibility of Results
発行所 推奨
誌名 必須 European Journal of Biochemistry([Federation of European Biochemical Societies])
(pISSN: 0014-2956, eISSN: 1432-1033)
ISSN 任意 0014-2956
ISSN: 0014-2956 (pISSN: 0014-2956, eISSN: 1432-1033)
Title: European journal of biochemistry
Title(ISO): Eur J Biochem
Publisher: Wiley-Blackwell Publishing Ltd
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 271
必須 11
必須 2241 2247
都市 任意
年月日 必須 2004年 5月 10日
URL 任意
DOI 任意 10.1111/j.1432-1033.2004.04161.x    (→Scopusで検索)
PMID 任意 15153114    (→Scopusで検索)
CRID 任意
WOS 任意 000221533600023
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.Affiliation: Division of Gene Expression, Institute for Genome Research, The University of Tokushima, Kuramotocho 3-18, Tokushima 770-8503, Japan. kataoka@genome.tokushima-u.ac.jp

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Evaluation Studies

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article