徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: 藤本 和久/[飯田 博一]/川上 雅子/板東 俊和/Tao Zhi-Fu/杉山 弘/Sequence-specific protection of plasmid DNA from restriction endonuclease hydrolysis by pyrrole-imidazole-cyclopropapyrroloindole conjugates/[Nucleic Acids Research]

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EID
71601
EOID
857633
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LastModified
2017年7月3日(月) 14:49:11
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三好 小文
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[学部長]/[徳島大学.歯学部]
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
  1. 東京医科歯科大学.生体材料工学研究所
  2. 科学技術振興事業団(1996年10月1日〜2003年9月30日)
著者 必須
  1. (英) Fujimoto Kazuhisa / (日) 藤本 和久 / (読) ふじもと かずひさ
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. 飯田 博一
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. (英) Kawakami Masako / (日) 川上 雅子 / (読) かわかみ まさこ
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Bando Toshikazu / (日) 板東 俊和 / (読) ばんどう としかず
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. (英) Tao Zhi-Fu
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  6. (英) Sugiyama Hiroshi / (日) 杉山 弘 / (読) すぎやま ひろし
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Sequence-specific protection of plasmid DNA from restriction endonuclease hydrolysis by pyrrole-imidazole-cyclopropapyrroloindole conjugates

副題 任意
要約 任意

(英) The pyrrole-imidazole (Py-Im) triamide-cyclopropa pyrroloindole (CPI) conjugates ImPyImLDu86 (7) and ImImPyLDu86 (14) were synthesized and their alkylating activities and inhibitory effects on DNA hydrolysis by restriction endonucleases were examined. Sequencing gel analysis demonstrated that conjugates 7 and 14 specifically alkylated DNA at 5'-CGCGCG-3' and 5'-PyGGCCPu-3', respectively. Agarose gel electrophoresis indicated that incubation of a supercoiled plasmid, pSPORT I (4109 bp), with conjugate 7 effectively inhibited its hydrolysis by BssHII (5'-G_CGCGC-3'), whereas conjugate 14 had no effect on this hydrolysis. These results suggest that conjugate 7 sequence-specifically inhibits the hydrolysis of DNA by BssHII. Sequence-specific alkylation by the Py-Im triamide-CPI conjugates was further confirmed by inhibition of the Eco52I (5'-C_GGCCG-3') hydrolysis of conjugate 14-treated pQBI PGK (5387 bp). In clear contrast, hydrolysis of pQB1 PGK by DraI (3'-TTT_AAA-3') was not inhibited by 5 micro M conjugate 14. That ImImPy did not inhibit the hydrolysis of pQB1 PGK indicates that covalent bond formation is necessary for inhibition. A similar experiment, using linear pQBI PGK, achieved the same extent of protection of the DNA with approximately half the concentration of conjugate 14 as was required to protect supercoiled DNA from hydrolysis.

キーワード 推奨
  1. (英) Alkylation
  2. (英) Base Sequence
  3. (英) DNA
  4. (英) DNA Restriction Enzymes
  5. (英) DNA, Superhelical
  6. (英) Deoxyribonucleases, Type II Site-Specific
  7. (英) Electrophoresis, Polyacrylamide Gel
  8. (英) Imidazoles
  9. (英) Plasmids
  10. (英) Pyrroles
  11. (英) Sequence Analysis, DNA
発行所 推奨
誌名 必須 Nucleic Acids Research([Oxford University Press])
(pISSN: 0305-1048, eISSN: 1362-4962)
ISSN 任意 1362-4962
ISSN: 0305-1048 (pISSN: 0305-1048, eISSN: 1362-4962)
Title: Nucleic acids research
Title(ISO): Nucleic Acids Res
Supplier: Oxford University Press
Publisher: Oxford University Press
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 30
必須 17
必須 3748 3753
都市 任意
年月日 必須 2002年 9月 1日
URL 任意
DOI 任意 10.1093/nar/gkf486    (→Scopusで検索)
PMID 任意 12202760    (→Scopusで検索)
CRID 任意
NAID 任意
WOS 任意 000177998100017
Scopus 任意 2-s2.0-0036712067
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  2. (英) OtherID: PMC137410