徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: [長﨑 裕加]/[森谷 眞紀]/[棚橋 俊仁]/Osabe Dai/Nomura Kyoko/Fujita Yuka/Keshavarz Parvaneh/Kunika Kiyoshi/Nakamura Naoto/[吉川 敏一]/Ichiishi Eiichiro/[塩田 洋]/[安井 夏生]/[井上 寛]/[板倉 光夫]/Lack of association of genetic variation in chromosome region 15q14-22.1 with type 2 diabetes in a Japanese population./[BMC Medical Genetics]

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EID
398876
EOID
1079900
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LastModified
2023年7月26日(水) 16:30:12
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長﨑 裕加
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長﨑 裕加
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. 長﨑 裕加([徳島大学.AWAサポートセンター])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨 ****
  2. 森谷 眞紀([徳島大学.ゲノム機能研究センター])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. 棚橋 俊仁
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Osabe Dai
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. (英) Nomura Kyoko
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  6. (英) Fujita Yuka
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  7. (英) Keshavarz Parvaneh
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  8. (英) Kunika Kiyoshi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  9. (英) Nakamura Naoto
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  10. 吉川 敏一([京都府立医科大学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  11. (英) Ichiishi Eiichiro
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  12. 塩田 洋
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  13. 安井 夏生
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  14. 井上 寛
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  15. 板倉 光夫
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Lack of association of genetic variation in chromosome region 15q14-22.1 with type 2 diabetes in a Japanese population.

副題 任意
要約 任意

(英) BACKGROUND: Chromosome 15q14-22.1 has been linked to type 2 diabetes (T2D) and its related traits in Japanese and other populations. The presence of T2D disease susceptibility variant(s) was assessed in the 21.8 Mb region between D15S118 and D15S117 in a Japanese population using a region-wide case-control association test. METHODS: A two-stage association test was performed using Japanese subjects: The discovery panel (Stage 1) used 372 cases and 360 controls, while an independent replication panel (Stage 2) used 532 cases and 530 controls. A total of 1,317 evenly-spaced, common SNP markers with minor allele frequencies > 0.10 were typed for each stage. Captured genetic variation was examined in HapMap JPT SNPs, and a haplotype-based association test was performed. RESULTS: SNP2140 (rs2412747) (C/T) in intron 33 of the ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 (UBR1) gene was selected as a landmark SNP based on repeated significant associations in Stage 1 and Stage 2. However, the marginal p value (p = 0.0043 in the allelic test, OR = 1.26, 95% CI = 1.07-1.48 for combined samples) was weak in a single locus or haplotype-based association test. We failed to find any significant SNPs after correcting for multiple testing. CONCLUSION: The two-stage association test did not reveal a strong association between T2D and any common variants on chromosome 15q14-22.1 in 1,794 Japanese subjects. A further association test with a larger sample size and denser SNP markers is required to confirm these observations.

キーワード 推奨
  1. (英) Adult
  2. (英) Aged
  3. (英) Case-Control Studies
  4. (英) Chromosome Mapping
  5. (英) Chromosomes, Human, Pair 15
  6. (英) Diabetes Mellitus, Type 2
  7. (英) Female
  8. (英) Genetic Variation
  9. (英) Haplotypes
  10. (英) Humans
  11. (英) Japan
  12. (英) Linkage Disequilibrium
  13. (英) Male
  14. (英) Middle Aged
  15. (英) Polymorphism, Single Nucleotide
発行所 推奨
誌名 必須 BMC Medical Genetics([BioMed Central Ltd.])
(eISSN: 1471-2350)
ISSN 任意 1471-2350
ISSN: 1471-2350 (eISSN: 1471-2350)
Title: BMC medical genetics
Title(ISO): BMC Med Genet
Publisher: BioMed Central
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 9
必須
必須 22 22
都市 任意
年月日 必須 2008年 5月 27日
URL 任意
DOI 任意 10.1186/1471-2350-9-22    (→Scopusで検索)
PMID 任意 18366806    (→Scopusで検索)
CRID 任意
WOS 任意
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.Affiliation: Division of Genetic Information, Institute for Genome Research, The University of Tokushima, 3-18-15, Kuramoto-cho, Tokushima, 770-8503, Japan. yama@genome.tokushima-u.ac.jp

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Research Support, Non-U.S. Gov't

  4. (英) OtherID: PMC2324080