著作: [長﨑 裕加]/[森谷 眞紀]/[棚橋 俊仁]/Osabe Dai/Nomura Kyoko/Fujita Yuka/Keshavarz Parvaneh/Kunika Kiyoshi/Nakamura Naoto/[吉川 敏一]/Ichiishi Eiichiro/[塩田 洋]/[安井 夏生]/[井上 寛]/[板倉 光夫]/Lack of association of genetic variation in chromosome region 15q14-22.1 with type 2 diabetes in a Japanese population./[BMC Medical Genetics]
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| 著者 | 必須 |
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| 題名 | 必須 |
(英) Lack of association of genetic variation in chromosome region 15q14-22.1 with type 2 diabetes in a Japanese population. |
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| 副題 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 要約 | 任意 |
(英) BACKGROUND: Chromosome 15q14-22.1 has been linked to type 2 diabetes (T2D) and its related traits in Japanese and other populations. The presence of T2D disease susceptibility variant(s) was assessed in the 21.8 Mb region between D15S118 and D15S117 in a Japanese population using a region-wide case-control association test. METHODS: A two-stage association test was performed using Japanese subjects: The discovery panel (Stage 1) used 372 cases and 360 controls, while an independent replication panel (Stage 2) used 532 cases and 530 controls. A total of 1,317 evenly-spaced, common SNP markers with minor allele frequencies > 0.10 were typed for each stage. Captured genetic variation was examined in HapMap JPT SNPs, and a haplotype-based association test was performed. RESULTS: SNP2140 (rs2412747) (C/T) in intron 33 of the ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 1 (UBR1) gene was selected as a landmark SNP based on repeated significant associations in Stage 1 and Stage 2. However, the marginal p value (p = 0.0043 in the allelic test, OR = 1.26, 95% CI = 1.07-1.48 for combined samples) was weak in a single locus or haplotype-based association test. We failed to find any significant SNPs after correcting for multiple testing. CONCLUSION: The two-stage association test did not reveal a strong association between T2D and any common variants on chromosome 15q14-22.1 in 1,794 Japanese subjects. A further association test with a larger sample size and denser SNP markers is required to confirm these observations. |
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| キーワード | 推奨 |
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| 発行所 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 誌名 | 必須 |
BMC Medical Genetics([BioMed Central Ltd.])
(eISSN: 1471-2350)
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| 巻 | 必須 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 号 | 必須 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 頁 | 必須 | 22 22 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 都市 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 年月日 | 必須 | 2008年 5月 27日 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| URL | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DOI | 任意 | 10.1186/1471-2350-9-22 (→Scopusで検索) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PMID | 任意 | 18366806 (→Scopusで検索) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CRID | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WOS | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Scopus | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 評価値 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 被引用数 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 指導教員 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 備考 | 任意 |
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