著作: Liu Yancheng/Takagi Yuko/Sugijanto Milyadi/Nguyen My Duong Kieu/[平田 章]/Hori Hiroyuki/Ho Kiong C./Genetic and Functional Analyses of Archaeal ATP-Dependent RNA Ligase in C/D Box sRNA Circularization and Ribosomal RNA Processing/[Frontiers in Molecular Biosciences]
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種別 | 必須 | 学術論文(審査論文) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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言語 | 必須 | 英語 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
招待 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
審査 | 推奨 | Peer Review | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
カテゴリ | 推奨 | 研究 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
共著種別 | 推奨 | 国際共著(徳島大学内研究者と国外研究機関所属研究者との共同研究) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
学究種別 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
組織 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
著者 | 必須 |
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題名 | 必須 |
(英) Genetic and Functional Analyses of Archaeal ATP-Dependent RNA Ligase in C/D Box sRNA Circularization and Ribosomal RNA Processing |
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副題 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
要約 | 任意 |
(英) RNA ligases play important roles in repairing and circularizing RNAs post-transcriptionally. In this study, we generated an allelic knockout of ATP-dependent RNA ligase (Rnl) in the hyperthermophilic archaeon to identify its biological targets. A comparative analysis of circular RNA reveals that the Rnl-knockout strain represses circularization of C/D box sRNAs without affecting the circularization of tRNA and rRNA processing intermediates. Recombinant archaeal Rnl could circularize C/D box sRNAs with a mutation in the conserved C/D box sequence element but not when the terminal stem structures were disrupted, suggesting that proximity of the two ends could be critical for intramolecular ligation. Furthermore, accumulates aberrant RNA fragments derived from ribosomal RNA in the absence of Rnl. These results suggest that Rnl is responsible for C/D box sRNA circularization and may also play a role in ribosomal RNA processing. |
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キーワード | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
発行所 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
誌名 | 必須 |
Frontiers in Molecular Biosciences(Frontiers Media S.A.)
(eISSN: 2296-889X)
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巻 | 必須 | 9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
号 | 必須 | 8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
頁 | 必須 | 811548 811548 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
都市 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
年月日 | 必須 | 2022年 3月 25日 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
URL | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DOI | 任意 | 10.3389/fmolb.2022.811548 (→Scopusで検索) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PMID | 任意 | 35445080 (→Scopusで検索) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CRID | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
WOS | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Scopus | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
評価値 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
被引用数 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
指導教員 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
備考 | 任意 |
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