徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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著作: Liu Yancheng/Takagi Yuko/Sugijanto Milyadi/Nguyen My Duong Kieu/[平田 章]/Hori Hiroyuki/Ho Kiong C./Genetic and Functional Analyses of Archaeal ATP-Dependent RNA Ligase in C/D Box sRNA Circularization and Ribosomal RNA Processing/[Frontiers in Molecular Biosciences]

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EID
385151
EOID
1044378
Map
0
LastModified
2022年5月21日(土) 21:05:06
Operator
大家 隆弘
Avail
TRUE
Censor
0
Owner
平田 章
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Write
継承
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継承
種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨 Peer Review
カテゴリ 推奨 研究
共著種別 推奨 国際共著(徳島大学内研究者と国外研究機関所属研究者との共同研究)
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. (英) Liu Yancheng
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Takagi Yuko
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. (英) Sugijanto Milyadi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Nguyen My Duong Kieu
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. 平田 章([徳島大学.大学院社会産業理工学研究部.理工学域.自然科学系.生物科学分野])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  6. (英) Hori Hiroyuki
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  7. (英) Ho Kiong C.
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Genetic and Functional Analyses of Archaeal ATP-Dependent RNA Ligase in C/D Box sRNA Circularization and Ribosomal RNA Processing

副題 任意
要約 任意

(英) RNA ligases play important roles in repairing and circularizing RNAs post-transcriptionally. In this study, we generated an allelic knockout of ATP-dependent RNA ligase (Rnl) in the hyperthermophilic archaeon to identify its biological targets. A comparative analysis of circular RNA reveals that the Rnl-knockout strain represses circularization of C/D box sRNAs without affecting the circularization of tRNA and rRNA processing intermediates. Recombinant archaeal Rnl could circularize C/D box sRNAs with a mutation in the conserved C/D box sequence element but not when the terminal stem structures were disrupted, suggesting that proximity of the two ends could be critical for intramolecular ligation. Furthermore, accumulates aberrant RNA fragments derived from ribosomal RNA in the absence of Rnl. These results suggest that Rnl is responsible for C/D box sRNA circularization and may also play a role in ribosomal RNA processing.

キーワード 推奨
発行所 推奨
誌名 必須 Frontiers in Molecular Biosciences(Frontiers Media S.A.)
(eISSN: 2296-889X)
ISSN 任意 2296-889X
ISSN: 2296-889X (eISSN: 2296-889X)
Title: Frontiers in molecular biosciences
Title(ISO): Front Mol Biosci
Publisher: Frontiers Media S.A.
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 9
必須 8
必須 811548 811548
都市 任意
年月日 必須 2022年 3月 25日
URL 任意
DOI 任意 10.3389/fmolb.2022.811548    (→Scopusで検索)
PMID 任意 35445080    (→Scopusで検索)
CRID 任意
WOS 任意
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.ELocationID: 10.3389/fmolb.2022.811548

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  3. (英) KeywordList.Keyword: C/D box sRNAs

  4. (英) KeywordList.Keyword: RNA ligase

  5. (英) KeywordList.Keyword: circular RNA

  6. (英) KeywordList.Keyword: rRNA processing

  7. (英) KeywordList.Keyword: thermococcus kodakarensis KOD1

  8. (英) CoiStatement: The authors declare that the research was conducted in the absence of any commercial or financial relationships that could be construed as a potential conflict of interest.