著作: Wanitcha Rachadech/[加藤 有介]/Rabab Mohamed Abou El Magd Ahmed/[宍戸 裕二]/Kim Soo Hyeon/曽我部 浩史/[真板 宣夫]/[頼田 和子]/[福井 清]/P219L substitution in human D-amino acid oxidase impacts the ligand binding and catalytic efficiency/[The Journal of Biochemistry]
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| 言語 | 必須 | 英語 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 招待 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 審査 | 推奨 | Peer Review | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| カテゴリ | 推奨 | 教育 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 共著種別 | 推奨 | 国際共著(徳島大学内研究者と国外研究機関所属研究者との共同研究) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 学究種別 | 推奨 | 博士課程学生による研究報告 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 組織 | 推奨 |
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| 著者 | 必須 |
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| 題名 | 必須 |
(英) P219L substitution in human D-amino acid oxidase impacts the ligand binding and catalytic efficiency |
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| 副題 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 要約 | 任意 |
(英) Human D-amino acid oxidase (DAO) is a flavoenzyme that is implicated in neurodegenerative diseases. We investigated the impact of replacement of proline with leucine at Position 219 (P219L) in the active site lid of human DAO on the structural and enzymatic properties, because porcine DAO contains leucine at the corresponding position. The turnover numbers (kcat) of P219L were unchanged, but its Km values decreased compared with wild-type, leading to an increase in the catalytic efficiency (kcat/Km). Moreover, benzoate inhibits P219L with lower Ki value (0.7-0.9 µM) compared with wild-type (1.2-2.0 µM). Crystal structure of P219L in complex with flavin adenine dinucleotide (FAD) and benzoate at 2.25 Å resolution displayed conformational changes of the active site and lid. The distances between the H-bond-forming atoms of arginine 283 and benzoate and the relative position between the aromatic rings of tyrosine 224 and benzoate were changed in the P219L complex. Taken together, the P219L substitution leads to an increase in the catalytic efficiency and binding affinity for substrates/inhibitors due to these structural changes. Furthermore, an acetic acid was located near the adenine ring of FAD in the P219L complex. This study provides new insights into the structure-function relationship of human DAO. |
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| キーワード | 推奨 |
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| 発行所 | 推奨 | 日本生化学会 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 誌名 | 必須 |
The Journal of Biochemistry([日本生化学会])
(pISSN: 0021-924X, eISSN: 1756-2651)
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| 巻 | 必須 | 168 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 号 | 必須 | 5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 頁 | 必須 | 557 567 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 都市 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 年月日 | 必須 | 2020年 11月 1日 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| URL | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DOI | 任意 | 10.1093/jb/mvaa083 (→Scopusで検索) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PMID | 任意 | 32730563 (→Scopusで検索) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CRID | 任意 | 1523669555785559936 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| WOS | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Scopus | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| researchmap | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 評価値 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 被引用数 | 任意 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 指導教員 | 推奨 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 備考 | 任意 |
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