徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: Nimura Keisuke/Yamamoto Masamichi/Takeichi Makiko/Saga Kotaro/[髙岡 勝吉]/Kawamura Norihiko/Nitta Hirohisa/Nagano Hiromichi/Ishino Saki/Tanaka Tatsuya/Schwartz Robert J/Aburatani Hiroyuki/Kaneda Yasufumi/Regulation of alternative polyadenylation by Nkx2-5 and Xrn2 during mouse heart development./[eLife]

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EID
363166
EOID
972129
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0
LastModified
2020年2月21日(金) 15:05:29
Operator
三木 ちひろ
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TRUE
Censor
0
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髙岡 勝吉
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種別 必須
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. (英) Nimura Keisuke
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Yamamoto Masamichi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. (英) Takeichi Makiko
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Saga Kotaro
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. 髙岡 勝吉([徳島大学.先端酵素学研究所.基幹研究部門])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  6. (英) Kawamura Norihiko
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  7. (英) Nitta Hirohisa
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  8. (英) Nagano Hiromichi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  9. (英) Ishino Saki
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  10. (英) Tanaka Tatsuya
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  11. (英) Schwartz Robert J
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  12. (英) Aburatani Hiroyuki
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  13. (英) Kaneda Yasufumi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Regulation of alternative polyadenylation by Nkx2-5 and Xrn2 during mouse heart development.

副題 任意
要約 任意

(英) Transcription factors organize gene expression profiles by regulating promoter activity. However, the role of transcription factors after transcription initiation is poorly understood. Here, we show that the homeoprotein Nkx2-5 and the 5'-3' exonuclease Xrn2 are involved in the regulation of alternative polyadenylation (APA) during mouse heart development. Nkx2-5 occupied not only the transcription start sites (TSSs) but also the downstream regions of genes, serving to connect these regions in primary embryonic cardiomyocytes (eCMs). Nkx2-5 deficiency affected Xrn2 binding to target loci and resulted in increases in RNA polymerase II (RNAPII) occupancy and in the expression of mRNAs with long 3'untranslated regions (3' UTRs) from genes related to heart development. siRNA-mediated suppression of Nkx2-5 and Xrn2 led to heart looping anomaly. Moreover, Nkx2-5 genetically interacts with Xrn2 because Nkx2-5(+/-)Xrn2(+/-), but neither Nkx2-5(+/-)nor Xrn2(+/-), newborns exhibited a defect in ventricular septum formation, suggesting that the association between Nkx2-5 and Xrn2 is essential for heart development. Our results indicate that Nkx2-5 regulates not only the initiation but also the usage of poly(A) sites during heart development. Our findings suggest that tissue-specific transcription factors is involved in the regulation of APA.

キーワード 推奨
  1. (英) Animals
  2. (英) Exoribonucleases
  3. (英) Gene Expression Regulation, Developmental
  4. 心臓(heart)
  5. (英) Homeobox Protein Nkx-2.5
  6. (英) Mice, Inbred C57BL
  7. (英) Mice, Knockout
  8. (英) Polyadenylation
発行所 推奨
誌名 必須 eLife(eLife Sciences Publications, Ltd.)
(eISSN: 2050-084X)
ISSN 任意 2050-084X
ISSN: 2050-084X (eISSN: 2050-084X)
Title: eLife
Title(ISO): Elife
Publisher: eLife Sciences Publications
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 5
必須
必須
都市 任意
年月日 必須 2016年 6月 22日
URL 任意
DOI 任意 10.7554/eLife.16030    (→Scopusで検索)
PMID 任意 27331609    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) PublicationType: Journal Article

  2. (英) PublicationType: Research Support, Non-U.S. Gov't