徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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著作: [沢津橋 俊]/上甲 裕大/[福本 誠二]/[松本 俊夫]/Sugano S. Shigeo/Development of versatile non-homologous end joining-based knock-in module for genome editing./[Scientific Reports]

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EID
348363
EOID
935942
Map
0
LastModified
2018年12月10日(月) 11:36:17
Operator
三木 ちひろ
Avail
TRUE
Censor
0
Owner
沢津橋 俊
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. 沢津橋 俊([徳島大学.先端酵素学研究所.基幹研究部門])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Joko Yudai / (日) 上甲 裕大 / (読) じょうこう ゆうだい
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨 ****
  3. 福本 誠二([徳島大学.先端酵素学研究所.基幹研究部門])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. 松本 俊夫
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. (英) Sugano S. Shigeo
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Development of versatile non-homologous end joining-based knock-in module for genome editing.

副題 任意
要約 任意

(英) CRISPR/Cas9-based genome editing has dramatically accelerated genome engineering. An important aspect of genome engineering is efficient knock-in technology. For improved knock-in efficiency, the non-homologous end joining (NHEJ) repair pathway has been used over the homology-dependent repair pathway, but there remains a need to reduce the complexity of the preparation of donor vectors. We developed the versatile NHEJ-based knock-in module for genome editing (VIKING). Using the consensus sequence of the time-honored pUC vector to cut donor vectors, any vector with a pUC backbone could be used as the donor vector without customization. Conditions required to minimize random integration rates of the donor vector were also investigated. We attempted to isolate null lines of the VDR gene in human HaCaT keratinocytes using knock-in/knock-out with a selection marker cassette, and found 75% of clones isolated were successfully knocked-in. Although HaCaT cells have hypotetraploid genome composition, the results suggest multiple clones have VDR null phenotypes. VIKING modules enabled highly efficient knock-in of any vectors harboring pUC vectors. Users now can insert various existing vectors into an arbitrary locus in the genome. VIKING will contribute to low-cost genome engineering.

キーワード 推奨
発行所 推奨
誌名 必須 Scientific Reports([Nature Publishing Group])
(eISSN: 2045-2322)
ISSN 任意 2045-2322
ISSN: 2045-2322 (eISSN: 2045-2322)
Title: Scientific reports
Title(ISO): Sci Rep
Publisher: Nature Publishing Group
 (NLM Catalog  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 8
必須 1
必須 593 593
都市 任意
年月日 必須 2018年 1月 12日
URL 任意
DOI 任意 10.1038/s41598-017-18911-9    (→Scopusで検索)
PMID 任意 29330493    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意
Scopus 任意 2-s2.0-85043529637
機関リポジトリ 112400
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.ELocationID: 10.1038/s41598-017-18911-9

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article