徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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著作: [川上 竜巳]/大志田 達也/[櫻庭 春彦]/[大島 敏久]/A novel PLP-dependent Alanine/Serine racemase from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT-3/[Frontiers in Microbiology]

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EID
342279
EOID
937959
Map
0
LastModified
2019年1月21日(月) 17:11:52
Operator
三木 ちひろ
Avail
TRUE
Censor
0
Owner
川上 竜巳
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨 Peer Review
カテゴリ 推奨 研究
共著種別 推奨 国内共著(徳島大学内研究者と国内(学外)研究者との共同研究 (国外研究者を含まない))
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. 川上 竜巳([徳島大学.大学院社会産業理工学研究部.生物資源産業学域.食料科学系.食料科学分野]/[徳島大学.生物資源産業学部])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Ohshida Tatsuya / (日) 大志田 達也
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. 櫻庭 春彦
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. 大島 敏久([九州大学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) A novel PLP-dependent Alanine/Serine racemase from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT-3

副題 任意
要約 任意

(英) We recently identified and characterized a novel broad substrate specificity amino acidracemase (BAR) from the hyperthermophilic archaeon Pyrococcus horikoshii OT-3.Three genes, PH0782, PH1423, and PH1501, encoding homologs exhibiting about45% sequence identity with BAR were present in the P. horikoshii genome. In this study,we detected pyridoxal 50-phosphate (PLP)-dependent amino acid racemase activity inthe protein encoded by PH0782. The enzyme showed activity toward Ala, Ser, Thr,and Val, but the catalytic efficiency with Thr or Val was much lower than with Ala orSer. The enzyme was therefore designated Ala/Ser racemase (ASR). Like BAR, ASRwas highly stable at high temperatures and over a wide range of pHs, though itshexameric structure differed from the dimeric structure of BAR. No activity was detectedin K291A or D234A ASR mutants. This suggests that, as in Ile 2-epimerase (ILEP) fromLactobacillus buchneri JCM1115, these residues are involved in Schiff base formationand substrate interaction, respectively. Unlike BAR, enhanced ASR activity was notdetected in P. horikoshii cells cultivated in the presence of D-Ala or D-Ser. This is thefirst description of a PLP-dependent fold type I ASR in archaea.

キーワード 推奨
  1. (英) Ala racemase
  2. (英) Ser racemase
  3. (英) PLP-dependent enzyme
  4. (英) Pyrococcus horikoshii
  5. (英) hyperthermophilic archaea
  6. (英) D-amino acid
発行所 推奨
誌名 必須 Frontiers in Microbiology(Frontiers Media S.A.)
(eISSN: 1664-302X)
ISSN 任意 1664-302X
ISSN: 1664-302X (eISSN: 1664-302X)
Title: Frontiers in microbiology
Title(ISO): Front Microbiol
Publisher: Frontiers Media S.A.
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 ---
必須 ---
必須 ---
都市 任意
年月日 必須 2018年 7月 9日
URL 任意
DOI 任意 10.3389/fmicb.2018.01481    (→Scopusで検索)
PMID 任意
NAID 任意
WOS 任意
Scopus 任意 2-s2.0-85049861690
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意