徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: Hatakeyama Tomomitsu/Ichise Ayaka/Unno Hideaki/[郷田 秀一郎]/Oda Tatsuya/Tateno Hiroaki/Hirabayashi Jun/[酒井 仁美]/[中川 秀幸]/Carbohydrate recognition by the rhamnose-binding lectin SUL-I with a novel three-domain structure isolated from the venom of globiferous pedicellariae of the flower sea urchin Toxopneustes pileolus/[Protein Science]

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EID
337040
EOID
937336
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0
LastModified
2018年12月28日(金) 16:58:12
Operator
三木 ちひろ
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TRUE
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酒井 仁美
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. (英) Hatakeyama Tomomitsu
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Ichise Ayaka
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. (英) Unno Hideaki
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. 郷田 秀一郎([長崎大学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. (英) Oda Tatsuya
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
    適合する可能性のある以下の学生情報を発見しました
    《小田 達也 (Oda Tatsuya) @ 理工学部 [学部学生] 2017年4月〜》
    《小田 達也 (Oda Tatsuya) @ 薬学部 [学部学生] 2015年4月〜》
    《小田 達也 (Oda Tatsuya) @ 先端技術科学教育部.博士前期課程 [大学院学生] 2013年4月〜2015年3月》
    《小田 達也 (Oda Tatsuya) @ 工学部 [学部学生] 2009年4月〜2013年3月》
    《小田 竜也 (Oda Tatsuya) @ 工学部 [学部学生] 2007年4月〜2011年3月》
    この情報が学生所属組織の業績等に分類されるためには学籍番号の登録が必要です.テキスト記載の個人が上記に掲げた個人本人ならば,学籍番号の登録を行ってください.(編集画面では学籍番号が表示されます)
  6. (英) Tateno Hiroaki
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  7. (英) Hirabayashi Jun
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  8. 酒井 仁美([徳島大学.技術支援部])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨 ****
  9. 中川 秀幸
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Carbohydrate recognition by the rhamnose-binding lectin SUL-I with a novel three-domain structure isolated from the venom of globiferous pedicellariae of the flower sea urchin Toxopneustes pileolus

副題 任意
要約 任意

(英) The globiferous pedicellariae of the venomous sea urchin Toxopneustes pileolus contains several biologically active proteins. We have cloned the cDNA of one of the toxin components, SUL-I, which is a rhamnose-binding lectin (RBL) that acts as a mitogen through binding to carbohydrate chains on target cells. Recombinant SUL-I (rSUL-I) was produced in Escherichia coli cells, and its carbohydrate-binding specificity was examined with the glycoconjugate microarray analysis, which suggested that potential target carbohydrate structures are galactose-terminated N-glycans. rSUL-I exhibited mitogenic activity for murine splenocyte cells and toxicity against Vero cells. The three-dimensional structure of the rSUL-I/l-rhamnose complex was determined by X-ray crystallographic analysis at a 1.8 Å resolution. The overall structure of rSUL-I is composed of three distinctive domains with a folding structure similar to those of CSL3, a RBL from chum salmon (Oncorhynchus keta) eggs. The bound l-rhamnose molecules are mainly recognized by rSUL-I through hydrogen bonds between its 2-, 3-, and 4-hydroxy groups and Asp, Asn, and Glu residues in the binding sites, while Tyr and Ser residues participate in the recognition mechanism. It was also inferred that SUL-I may form a dimer in solution based on the molecular size estimated via dynamic light scattering as well as possible contact regions in its crystal structure.

キーワード 推奨
  1. (英) Amino Acid Sequence
  2. (英) Animal Structures
  3. (英) Animals
  4. (英) Binding Sites
  5. (英) Carbohydrate Sequence
  6. (英) Cercopithecus aethiops
  7. (英) Cloning, Molecular
  8. X線結晶学(X-ray crystallography)
  9. 大腸菌(Escherichia coli)
  10. 遺伝子発現(gene expression)
  11. (英) Hydrogen Bonding
  12. (英) Lectins
  13. (英) Lymphocytes
    データベース中に適合する可能性のある以下の情報を発見しました
    [キーワード] Tリンパ球 (T lymphocytes)
  14. (英) Marine Toxins
  15. (英) Mice
    データベース中に適合する可能性のある以下の情報を発見しました
    [キーワード] ノックアウトマウス (knockout mice)
  16. (英) Microarray Analysis
  17. (英) Mitogens
  18. (英) Models, Molecular
  19. (英) Polysaccharides
  20. (英) Protein Binding
    データベース中に適合する可能性のある以下の情報を発見しました
    [キーワード] レニン結合蛋白質 (Renin Binding Protein)
  21. (英) Protein Interaction Domains and Motifs
  22. (英) Protein Multimerization
  23. (英) Protein Structure, Secondary
  24. (英) Recombinant Proteins
  25. (英) Rhamnose
  26. (英) Sea Urchins
  27. (英) Vero Cells
発行所 推奨
誌名 必須 Protein Science(Protein Society)
(pISSN: 0961-8368, eISSN: 1469-896X)
ISSN 任意 1469-896X
ISSN: 0961-8368 (pISSN: 0961-8368, eISSN: 1469-896X)
Title: Protein science : a publication of the Protein Society
Title(ISO): Protein Sci.
Supplier: The Protein Society
Publisher: Wiley Publishing
 (NLM Catalog  (Wiley  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 276
必須 8
必須 1574 1583
都市 任意
年月日 必須 2017年 5月 12日
URL 任意
DOI 任意 10.1002/pro.3185    (→Scopusで検索)
PMID 任意 28470711    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意
Scopus 任意 2-s2.0-85018917301
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.ELocationID: 10.1002/pro.3185

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  3. (英) KeywordList.Keyword: X-ray crystallographic analysis

  4. (英) KeywordList.Keyword: lectin

  5. (英) KeywordList.Keyword: rhamnose

  6. (英) KeywordList.Keyword: sea urchin

  7. (英) KeywordList.Keyword: toxin