徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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著作: Venkatesh Thejaswini/Suresh S. Padmanaban/[堤 理恵]/tRFs: miRNAs in disguise./[Gene]

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EID
332558
EOID
870249
Map
0
LastModified
2017年8月28日(月) 18:49:59
Operator
大家 隆弘
Avail
TRUE
Censor
0
Owner
堤 理恵
Read
継承
Write
継承
Delete
継承
種別 必須
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. (英) Venkatesh Thejaswini
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Suresh S. Padmanaban
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. 堤 理恵([徳島大学.大学院医歯薬学研究部.医学域.栄養科学部門.医科栄養学系.代謝栄養学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) tRFs: miRNAs in disguise.

副題 任意
要約 任意

(英) tRFs and tiRNAs are two new classes of regulatory non-coding small RNAs that are derived from the cleavage of pre-existing tRNAs. tRFs are 18-22 nt long and are classified into the tRF-5, tRF-3, and tRF-1 series. Here, we discuss in detail the regulatory roles of tRFs in translation, viral infections, and carcinogenesis. Moreover, we have reviewed the association of tRFs with Argonaute proteins, including their potential to function as miRNAs. Interestingly, few miRNAs are generated from pre-existing tRNAs. Hence, tRNAs generate similar-sized tRFs and miRNAs, leading to misannotations due to cross mapping of tRFs and tRNA-derived miRNAs during deep sequencing data analysis. Therefore, it is important to catalogue the overlapping sequences between tRNA-derived miRNAs and tRFs. We have catalogued the miRNAs that overlap with tRFs sequences in humans using miRBase. We identified 20 tRNA-derived miRNAs that share sequences with tRFs. Of the 20 miRNAs, 5 miRNAs (miR-3182, miR-4521, miR-1260a, miR-1260b, and miR-7977) showed significant prediction scores. Furthermore, we have identified a lysine degradation pathway as a common regulatory pathway for miR-1260a, miR-1260b, and miR-3182 by using DIANA-mirPath.

キーワード 推奨
  1. (英) Argonaute Proteins
  2. (英) High-Throughput Nucleotide Sequencing
  3. (英) Humans
  4. (英) MicroRNAs
  5. (英) Protein Binding
  6. (英) Protein Biosynthesis
  7. (英) RNA, Transfer
発行所 推奨
誌名 必須 Gene([Elsevier Science B.V.])
(pISSN: 0378-1119, eISSN: 1879-0038)
ISSN 任意 1879-0038
ISSN: 0378-1119 (pISSN: 0378-1119, eISSN: 1879-0038)
Title: Gene
Title(ISO): Gene
Publisher: Elsevier BV
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 579
必須 2
必須 133 138
都市 任意
年月日 必須 2015年 12月 29日
URL 任意
DOI 任意 10.1016/j.gene.2015.12.058    (→Scopusで検索)
PMID 任意 26743126    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.ELocationID: 10.1016/j.gene.2015.12.058

  2. (英) Article.ELocationID: S0378-1119(15)01570-X

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  4. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Review

  5. (英) KeywordList.Keyword: miRNAs

  6. (英) KeywordList.Keyword: tRFs

  7. (英) KeywordList.Keyword: tRNAs