徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: [加藤 有介]/[福井 清]/Structure models of G72, the product of a susceptibility gene to schizophrenia/[The Journal of Biochemistry]

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EID
322896
EOID
978361
Map
0
LastModified
2020年4月20日(月) 18:44:49
Operator
大家 隆弘
Avail
TRUE
Censor
承認済
Owner
福井 清
Read
継承
Write
継承
Delete
継承
種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨 Peer Review
カテゴリ 推奨 研究
共著種別 推奨 単独著作(徳島大学内の単一の研究グループ(研究室等)内の研究 (単著も含む))
学究種別 推奨
組織 推奨
  1. 徳島大学.先端酵素学研究所.次世代酵素学研究領域(2016年4月1日〜2020年3月31日)
著者 必須
  1. 加藤 有介
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. 福井 清([徳島大学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Structure models of G72, the product of a susceptibility gene to schizophrenia
副題 任意
要約 任意

(英) The G72 gene is one of the most susceptible genes to schizophrenia and is contained exclusively in the genomes of primates. The product of the G72 gene modulates the activity of D-amino acid oxidase (DAO) and is a small protein prone to aggregate, which hampers its structural studies. In addition, lack of a known structure of a homologue makes it difficult to use the homology modelling method for the prediction of the structure. Thus, we first developed a hybrid ab initio approach for small proteins prior to the prediction of the structure of G72. The approach uses three known ab initio algorithms. To evaluate the hybrid approach, we tested our prediction of the structure of the amino acid sequences whose structures were already solved and compared the predicted structures with the experimentally solved structures. Based on these comparisons, the average accuracy of our approach was calculated to be ∼5 Å. We then applied the approach to the sequence of G72 and successfully predicted the structures of the N- and C-terminal domains (ND and CD, respectively) of G72. The predicted structures of ND and CD were similar to membrane-bound proteins and adaptor proteins, respectively.
キーワード 推奨
  1. (英) Algorithms
  2. (英) Amino Acid Sequence
  3. (英) Carrier Proteins
  4. (英) Computational Biology
  5. (英) Genetic Predisposition to Disease
  6. (英) Genetic Variation
  7. (英) Humans
  8. (英) Intracellular Signaling Peptides and Proteins
  9. (英) Molecular Dynamics Simulation
  10. (英) Protein Domains
  11. (英) Protein Structure, Secondary
  12. (英) Reproducibility of Results
  13. (英) Schizophrenia
発行所 推奨 日本生化学会
誌名 必須 The Journal of Biochemistry([日本生化学会])
(pISSN: 0021-924X, eISSN: 1756-2651)
ISSN 任意 1756-2651
ISSN: 0021-924X (pISSN: 0021-924X, eISSN: 1756-2651)
Title: Journal of biochemistry
Title(ISO): J Biochem
Supplier: Oxford University Press
Publisher: Oxford University Press
 (NLM Catalog)   (医中誌Web)   (J-STAGE)   (Scopus)   (CrossRef)  (Scopus information is found. [need login])
巻 必須 161
号 必須 2
頁 必須 223 230
都市 任意 オックスフォード(Oxford/[連合王国])
年月日 必須 2017年 2月 1日
URL 任意
DOI 任意 10.1093/jb/mvw064    (→Scopusで検索)
PMID 任意 27815320    (→Scopusで検索)
CRID 任意
WOS 任意
Scopus 任意 2-s2.0-85015838860
機関リポジトリ 110891
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意

  1. (英) Article.ELocationID: 10.1093/jb/mvw064

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  3. (英) KeywordList.Keyword: D-amino acid oxidase

  4. (英) KeywordList.Keyword: G72

  5. (英) KeywordList.Keyword: ab initio method

  6. (英) KeywordList.Keyword: schizophrenia

  7. (英) KeywordList.Keyword: structure prediction