徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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著作: Akaike Yoko/Kurokawa Ken/Kajita Keisuke/[桑野 由紀]/[増田 清士]/[西田 憲生]/Wan Kang Seung/[棚橋 俊仁]/[六反 一仁]/Skipping of an alternative intron in the srsf1 3' untranslated region increases transcript stability./[The Journal of Medical Investigation : JMI]

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EID
253493
EOID
877587
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0
LastModified
2017年12月4日(月) 13:58:55
Operator
[ADMIN]
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TRUE
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0
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増田 清士
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. (英) Akaike Yoko
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Kurokawa Ken
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. (英) Kajita Keisuke
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. 桑野 由紀([徳島大学.大学院医歯薬学研究部.医学域.医科学部門.生理系.遺伝情報医学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. 増田 清士
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  6. 西田 憲生([徳島大学.大学院医歯薬学研究部.医学域.医科学部門.生理系.遺伝情報医学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  7. (英) Wan Kang Seung
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  8. 棚橋 俊仁
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  9. 六反 一仁
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Skipping of an alternative intron in the srsf1 3' untranslated region increases transcript stability.

副題 任意
要約 任意

(英) The srsf1 gene encodes serine/arginine-rich splicing factor 1 (SRSF1) that participates in both constitutive and alternative splicing reactions. This gene possesses two ultraconserved elements in the 3' untranslated region (UTR). Skipping of an alternative intron between the two elements has no effect on the protein-coding sequence, but it generates a premature stop codon (PTC)-containing mRNA isoform, whose degradation is considered to depend on nonsense-mediated mRNA decay (NMD). However, several cell lines (HCT116, RKO, HeLa, and WI38 cells) constitutively expressed significant amounts of the srsf1 PTC variant. HCT116 cells expressed the PTC variant nearly equivalent to the major isoform that includes the alternative intron in the 3' UTR. Inhibition of NMD by silencing a key effecter UPF1 or by treatment with cycloheximide failed to increase amounts of the PTC variant in HCT116 cells, and the PTC variant was rather more stable than the major isoform in the presence of actinomycin D. Our results suggest that the original stop codon may escape from the NMD surveillance even in skipping of the alternative intron. The srsf1 gene may produce an alternative splice variant having truncated 3' UTR to relief the microRNA- and/or RNA-binding protein-mediated control of translation or degradation. J. Med. Invest. 58: 180-187, August, 2011.

キーワード 推奨
発行所 推奨
誌名 必須 The Journal of Medical Investigation : JMI([徳島大学.医学部])
(pISSN: 1343-1420, eISSN: 1349-6867)
ISSN 任意 1349-6867
ISSN: 1343-1420 (pISSN: 1343-1420, eISSN: 1349-6867)
Title: The journal of medical investigation : JMI
Title(ISO): J Med Invest
Supplier: 徳島大学
Publisher: Tokushima Daigaku Igakubu
 (NLM Catalog  (Webcat Plus  (医中誌Web  (J-STAGE  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 58
必須 3-4
必須 180 187
都市 任意
年月日 必須 2011年 8月 初日
URL 任意
DOI 任意 10.2152/jmi.58.180    (→Scopusで検索)
PMID 任意 21921418    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意
Scopus 任意
機関リポジトリ 83832
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.Affiliation: Department of Stress Science, Institute of Health Biosciences, the University of Tokushima Graduate School.

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article