徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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著作: [吉田 達貞]/Shimizu Miho/Harada Masataka/Hitaoka Seiji/[中馬 寛]/Reassessment of Hammett sigma as an effective parameter representing intermolecular interaction energy - links between traditional and modern QSAR approaches/[Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters]

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EID
243359
EOID
1027683
Map
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LastModified
2022年2月1日(火) 16:37:45
Operator
三木 ちひろ
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Owner
[副研究部長]/[徳島大学.大学院医歯薬学研究部]
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
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審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. 吉田 達貞
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Shimizu Miho
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. (英) Harada Masataka
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Hitaoka Seiji
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. 中馬 寛
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Reassessment of Hammett sigma as an effective parameter representing intermolecular interaction energy - links between traditional and modern QSAR approaches
副題 任意
要約 任意

(英) The Hammett constant has for a long time been known to be one of most important linear free-energy related parameters that correlate with biological activity. It is a conventionally used electronic parameter in studies of enzymatic quantitative structure-activity relationships (QSAR). However, it is not necessarily obvious why represents variations in the free-energy change associated with the complex formation between a congeneric series of ligands with their target protein. So far, several powerful molecular calculations, such as the ab initio fragment molecular orbital (FMO) one, that are directly applicable to ligand-protein complexes have emerged. In this study, we comprehensively reevaluate experimentally derived parameter confirming it represents intermolecular interaction energy terms, by applying molecular orbital (MO) calculations to a simple ligand-protein complex model. The current results provide a rational and quantitative basis for bridging the gap between the traditional QSAR approach and 'the modern QSAR one', which involves the molecular calculations to evaluate the overall free-energy change for complex formation.
キーワード 推奨
  1. (英) Acetophenones
  2. (英) Algorithms
  3. (英) Biophysics
  4. (英) Chemistry
  5. (英) Ligands
  6. (英) Models, Chemical
  7. (英) Molecular Conformation
  8. (英) Protein Binding
  9. (英) Proteins
  10. (英) Quantitative Structure-Activity Relationship
  11. (英) Static Electricity
  12. (英) Thermodynamics
発行所 推奨
誌名 必須 Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters([Elsevier Science])
(pISSN: 0960-894X, eISSN: 1464-3405)
ISSN 任意 1464-3405
ISSN: 0960-894X (pISSN: 0960-894X, eISSN: 1464-3405)
Title: Bioorganic & medicinal chemistry letters
Title(ISO): Bioorg Med Chem Lett
Publisher: Elsevier Ltd
 (NLM Catalog)   (Scopus)   (CrossRef)  (Scopus information is found. [need login])
巻 必須 22
号 必須 ---
頁 必須 124 128
都市 任意
年月日 必須 2012年 1月 1日
URL 任意
DOI 任意 10.1016/j.bmcl.2011.11.047    (→Scopusで検索)
PMID 任意 22172696    (→Scopusで検索)
CRID 任意
WOS 任意 000298636700019
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意

  1. (英) Article.ELocationID: 10.1016/j.bmcl.2011.11.047

  2. (英) Article.Affiliation: Institute of Health Biosciences, The University of Tokushima Graduate School, 1-78 Shomachi, Tokushima 770-8505, Japan.

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article