徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: Hitaoka Seiji/Harada Masataka/[吉田 達貞]/[中馬 寛]/Correlation Analyses on Binding Affinity of Sialic Acid Analogues with Influenza Virus Neuraminidase-1 Using ab Initio MO Calculations on Their Complex Structures/[Journal of Chemical Information and Modeling]

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EID
224401
EOID
1027336
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LastModified
2022年1月26日(水) 17:10:41
Operator
三木 ちひろ
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Owner
[副研究部長]/[徳島大学.大学院医歯薬学研究部]
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. (英) Hitaoka Seiji
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Harada Masataka
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. 吉田 達貞
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. 中馬 寛
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Correlation Analyses on Binding Affinity of Sialic Acid Analogues with Influenza Virus Neuraminidase-1 Using ab Initio MO Calculations on Their Complex Structures

副題 任意
要約 任意

(英) We carried out full ab initio molecular orbital calculations on complexes between neuraminidase-1 (N1-NA) in the influenza A virus and a series of eight sialic acid analogues including oseltamivir (Tamiflu) in order to quantitatively examine the binding mechanism and variation in the inhibitory potency at the atomic and electronic levels. FMO-MP2-IFIE (interfragment interaction energy at the MP2 level of ab initio fragment molecular orbital calculations) analyses quantitatively revealed (1) that the complex formation is driven by strong electrostatic interactions of charged functional groups in the analogues with ionized amino acid residues and water molecules in the active site of N1-NA, and (2) that the variation in the inhibitory potency among the eight analogues is determined by the dispersion and/or hydrophobic interaction energies of the 3-pentyl ether and charged amino moieties in oseltamivir with certain residues and water molecules in the active site of N1-NA. The current results will be useful for the development of new antiinfluenza drugs with high potency against various subtypes of wild-type and drug-resistant NAs.

キーワード 推奨
  1. (英) Animals
  2. (英) Antiviral Agents
  3. (英) Binding Sites
  4. (英) Humans
  5. (英) Influenza A virus
  6. (英) Models, Molecular
  7. (英) N-Acetylneuraminic Acid
  8. (英) Neuraminidase
  9. (英) Orthomyxoviridae Infections
  10. (英) Oseltamivir
  11. (英) Protein Binding
発行所 推奨
誌名 必須 Journal of Chemical Information and Modeling([アメリカ化学会])
(pISSN: 1549-9596, eISSN: 1549-960X)
ISSN 任意 1549-960X
ISSN: 1549-9596 (pISSN: 1549-9596, eISSN: 1549-960X)
Title: Journal of chemical information and modeling
Title(ISO): J Chem Inf Model
Publisher: American Chemical Society
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 50
必須 10
必須 1796 1805
都市 任意
年月日 必須 2010年 10月 15日
URL 任意
DOI 任意 10.1021/ci100225b    (→Scopusで検索)
PMID 任意 20863103    (→Scopusで検索)
CRID 任意
WOS 任意
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.Affiliation: Institute of Health Biosciences, The University of Tokushima Graduate School, 1-78 Shomachi, Tokushima 770-8505, Japan.

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Research Support, Non-U.S. Gov't