徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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著作: Hirano Ken/Yoshida Yuichiro/Ishido Tomomi/Wada Yukihisa/Moriya Naoji/[山﨑 尚志]/Mizushina Yoshiyuki/[馬場 嘉信]/[石川 満]/Consecutive incorporation of fluorophore-labeled nucleotides by mammalian DNA polymerase beta/[Analytical Biochemistry: Methods in the Biological Sciences]

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EID
221462
EOID
689959
Map
0
LastModified
2013年6月7日(金) 15:09:53
Operator
松井 栄里
Avail
TRUE
Censor
0
Owner
山﨑 尚志
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継承
種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨 研究
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. (英) Hirano Ken
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Yoshida Yuichiro
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. (英) Ishido Tomomi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Wada Yukihisa
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. (英) Moriya Naoji
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  6. 山﨑 尚志([徳島大学.大学院医歯薬学研究部.薬学域.薬科学部門.生命薬学系.薬物治療学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  7. (英) Mizushina Yoshiyuki
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  8. 馬場 嘉信
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  9. 石川 満([独立行政法人 産業技術総合研究所])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Consecutive incorporation of fluorophore-labeled nucleotides by mammalian DNA polymerase beta

副題 任意
要約 任意

(英) In the present study, we investigated mammalian polymerases that consecutively incorporate various fluorophore-labeled nucleotides. We found that rat DNA polymerase beta (pol beta) consecutively incorporated fluorophore-labeled nucleotides to a greater extent than four bacterial polymerases, Sequenase Version 2.0, Vent(R) (exo-), DNA polymerase IIIalpha and the Klenow fragment, and the mammalian polymerases DNA polymerase alpha and human DNA polymerase delta, under mesophilic conditions. Furthermore, we investigated the kinetics of correct or mismatched incorporation with labeled nucleotides during synthesis by rat pol beta. The kinetic parameters K(m) and k(cat) were measured and used for evaluating: (i) the discrimination against correct pair incorporation of labeled nucleotides relative to unlabeled nucleotides; and (ii) the fidelity for all nucleotide combinations of mismatched pairs in the presence of labeled or unlabeled nucleotides. We also investigated the effect of fluorophore-labeled nucleotides on terminal deoxynucleotidyl transferase activity of rat pol beta. We have demonstrated for the first time that mammalian pol beta can consecutively incorporate various fluorophore-labeled dNTPs. These findings suggest that pol beta is useful for high-density labeling of DNA probes and single-molecule sequencing for high-speed genome analysis.

キーワード 推奨
  1. (英) Animals
  2. (英) DNA Nucleotidylexotransferase
  3. (英) DNA Polymerase III
  4. (英) DNA Polymerase beta
  5. (英) DNA Probes
  6. (英) Fluorescein
  7. (英) Fluorescent Dyes
  8. (英) Humans
  9. (英) Nucleotides
  10. (英) Rats
発行所 推奨 Elsevier(->組織[Elsevier Science])
誌名 必須 Analytical Biochemistry: Methods in the Biological Sciences([Elsevier Science])
(pISSN: 0003-2697, eISSN: 1096-0309)
ISSN 任意 1096-0309
ISSN: 0003-2697 (pISSN: 0003-2697, eISSN: 1096-0309)
Title: Analytical biochemistry
Title(ISO): Anal Biochem
Publisher: Elsevier Inc.
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 405
必須 2
必須 160 167
都市 任意
年月日 必須 2010年 10月 初日
URL 任意
DOI 任意 10.1016/j.ab.2010.06.005    (→Scopusで検索)
PMID 任意 20570644    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意 000281296300003
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.Affiliation: Nano-Bioanalysis Team, Health Technology Research Center, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Takamatsu, Kagawa 761-0395, Japan. hirano-ken@aist.go.jp

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Research Support, Non-U.S. Gov't