徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

1. 講義

(英) The goal is to understand the structure and function of biological macromolecules from the perspective of molecular recognition and interaction.

(日) タンパク質や核酸などの生体高分子の立体構造と機能について，分子認識及び分子間相互作用を中心に理解する．

(英) How do biological macromolecules recognize the target molecule and function? An introduction to the basic structural biology and stereochemistry of biological macromolecules. Topics include protein and nucleic acid structure. Students should make presentations focusing the molecular recognition and interaction of biological macromolecules based on the PDB data and their recent scientific papers with molecular modeling software "MacroModel".

(日) 生体高分子がどのように基質やドラッグなどの標的分子を認識して作用するかについて，核酸やタンパク質と低分子に関する構造学，立体化学および反応機構について概説する．また，分子モデリングとドラッグデザインについて概説した後，タンパク質データバンク(PDB)データベースから得られた立体構造について分子モデリングソフトウェア"MacroModel"を用いて解析する．

1. (英) molecular interaction / (日) 分子間相互作用
2. (英) molecular recognition / (日) 分子認識
3. (英) protein data bank / (日) タンパク質データバンク
4. (英) molrecular modeling / (日) 分子モデリング

(英) To understand the organic chemistry, medicinal chemistry, and the enzyme engineering

(日) 学部教育における有機化学，創薬化学および酵素工学を理解していること．

(英) None

(日) なし

1. (英) To understand the principle of structure and function of biological macromolecule.

   (日) 生体高分子の構造と機能の原理を理解する

2. (英) To understand the mechanisms of molecular recognition of biological macromolecule through PDB database search and molecular modeling software.

   (日) タンパク質データバンクのデータベースと分子モデリングソフトウェアを活用し生体高分子の分子認識機構を理解する

1. (英) Orientation

   (日) 講義概要の説明

2. (英) Lecture 1: force interactions involved in the drug-protein complex

   (日) 講義(1): 薬剤-タンパク質複合体の力学的相互作用

3. (英) Exercise 1: search for a protein target for drug

   (日) 演習(1): 薬剤に対する標的タンパク質の検索

4. (英) Lecture 2: stereochemical interactions involved in the drug-protein complex

   (日) 講義(2): 薬剤-タンパク質複合体の立体化学的相互作用

5. (英) Exercise 2: search for 3D structures of targeting protein from the PDB

   (日) 演習(2): PDBを用いた標的タンパク質3D構造の検索

6. (英) Lecture 3: mechanisms of enzyme catalysis

   (日) 講義(3): 酵素触媒の反応機構

7. (英) Exercise 3: conformational analysis of targeting protein

   (日) 演習(3): 標的タンパク質の構造解析

8. (英) Lecture 4: drug design and drug action

   (日) 講義(4): 薬物分子設計および薬物作用機構

9. (英) Exercise 4: conformational analysis of drug

   (日) 演習(4): 薬剤の構造解析

10. (英) Lecture 5: Drug design with computational chemistry

    (日) 講義(5): コンピュータ化学を用いたドラッグデザイン

11. (英) Exercise 5: molecular modeling of drug

    (日) 演習(5): 薬剤の分子モデリング

12. (英) Lecture 6: Molecular modeling with MacroModel

    (日) 講義(6): MacroModelを用いた分子モデリング

13. (英) Exercise 6: molecular modeling of protein

    (日) 演習(6): タンパク質の分子モデリング

14. (英) Exercise 7: molecular modeling of drug-protein complex

    (日) 演習(7): 薬剤-タンパク質複合体の分子モデリング

15. (英) Exercise 8: evaluation of molecular modeling

    (日) 演習(8): 分子モデリングの評価

16. (英) Report

    (日) レポート

(英) Report 100%

(日) レポート(100%)で評価する．

1. 宇都 義浩([徳島大学.大学院社会産業理工学研究部.生物資源産業学域.応用生命系.応用生物資源学分野]/[徳島大学.生物資源産業学部.生物資源産業学科.応用生命コース])

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