徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: [森谷 眞紀]/Nomura Kyoko/[棚橋 俊仁]/Osabe Dai/Fujita Yuka/Syuichi Shinohara/Yamaguchi Yuka/Keshavarz Parvaneh/[工藤 英治]/Nakamura Naoto/[吉川 敏一]/Ichiichi Eiichiro/Takata Yoichiro/[安井 夏生]/[塩田 洋]/Kunika Kiyoshi/[井上 寛]/[板倉 光夫]/Genetic association of single nucleotide polymorphisms in endonuclease G-like 1 gene with type 2 diabetes in a Japanese population./[Diabetologia]

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EID
187050
EOID
665086
Map
0
LastModified
2012年10月13日(土) 21:39:22
Operator
大家 隆弘
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TRUE
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0
Owner
安井 夏生
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
  1. 徳島大学.ゲノム機能研究センター(〜2008年3月31日/->組織[徳島大学.疾患プロテオゲノム研究センター])
著者 必須
  1. 森谷 眞紀(香川小児病院)
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Nomura Kyoko
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. 棚橋 俊仁
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Osabe Dai
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. (英) Fujita Yuka
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  6. (英) Syuichi Shinohara
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  7. (英) Yamaguchi Yuka
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  8. (英) Keshavarz Parvaneh
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  9. 工藤 英治
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  10. (英) Nakamura Naoto
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  11. 吉川 敏一([京都府立医科大学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  12. (英) Ichiichi Eiichiro
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  13. (英) Takata Yoichiro
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  14. 安井 夏生
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  15. 塩田 洋
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  16. (英) Kunika Kiyoshi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  17. 井上 寛
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  18. 板倉 光夫
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Genetic association of single nucleotide polymorphisms in endonuclease G-like 1 gene with type 2 diabetes in a Japanese population.

副題 任意
要約 任意

(英) In order to identify type 2 diabetes disease susceptibility gene(s) in a Japanese population, we applied a region-wide case-control association test to the 20.4 Mb region between D3S1293 and D3S2319 on chromosome 3p24.3-22.1, supported by linkage to type 2 diabetes and its related traits in Japanese and multiple populations. We performed a two-stage association test using 1,762 Japanese persons with 485 gene-centric, evenly spaced, common single nucleotide polymorphism (SNP) markers with minor allele frequency >0.1. For mouse studies, total RNA was extracted from various organs of BKS.Cg-+Lepr(db)/+Lepr(db) and control mice, and from MIN6, NIH3T3 and C2C12 cell lines. We detected a landmark SNP375 (A/G) (rs2051211, p = 0.000046, odds ratio = 1.33, 95% CI 1.16-1.53) in intron 5 of the endonuclease G-like 1 (ENDOGL1) gene. Systematic dense SNPs approach identified a susceptibility linkage disequilibrium (LD) block of 116.5 kb by |D'|, an LD units map and a critical region of 2.1 kb by r (2) in ENDOGL1. A haplotype-based association test showed that an at-risk haplotype is associated with disease status (p = 0.00001). The expression of ENDOGL1 was rather ubiquitous with relatively abundant expression in the brain and also in a pancreatic islet beta cell line. Mouse Endogl1 expression increased in pancreatic islets of hyperglycaemic BKS.Cg-+Lepr(db)/+Lepr(db) mice compared with that in control mice. Based on the population genetics, fine mapping of LD block and haplotype analysis, we conclude that ENDOGL1 is a candidate disease-susceptibility gene for type 2 diabetes in a Japanese population. Further analysis in a larger sample size is required to substantiate this conclusion.

キーワード 推奨
  1. (英) Adult
  2. (英) Aged
  3. (英) Body Mass Index
  4. (英) Case-Control Studies
  5. (英) Diabetes Mellitus, Type 2
  6. (英) Endodeoxyribonucleases
  7. (英) Endonucleases
  8. (英) Female
  9. (英) Genetic Predisposition to Disease
  10. (英) Hemoglobin A, Glycosylated
  11. (英) Humans
  12. (英) Japan
  13. (英) Male
  14. (英) Middle Aged
  15. (英) Polymorphism, Single Nucleotide
  16. (英) Reference Values
発行所 推奨
誌名 必須 Diabetologia(The European Association for the Study of Diabetes)
(pISSN: 0012-186X, eISSN: 1432-0428)
ISSN 任意 0012-186X
ISSN: 0012-186X (pISSN: 0012-186X, eISSN: 1432-0428)
Title: Diabetologia
Title(ISO): Diabetologia
Publisher: Springer
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 50
必須 6
必須 1218 1227
都市 任意
年月日 必須 2007年 1月 初日
URL 任意
DOI 任意 10.1007/s00125-007-0631-2    (→Scopusで検索)
PMID 任意 17415550    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.Affiliation: Division of Genetic Information, Institute for Genome Research, The University of Tokushima, 3-18-15 Kuramoto-cho, Tokushima 770-8503, Japan.

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Multicenter Study

  4. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Research Support, Non-U.S. Gov't