徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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授業概要: 2008/生体高分子化学特論

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EID
169416
EOID
391020
Map
[2007/生体高分子化学特論]
LastModified
2008年1月17日(木) 16:14:17
Operator
宇都 義浩
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TRUE
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0
Owner
[教務委員会委員]/[徳島大学.工学部.生物工学科]
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種別 必須 先端技術科学教育部 (授業概要)
入学年度 必須 西暦 2008年 (平成 20年)
名称 必須 (英) Biological macromolecular chemistry / (日) 生体高分子化学特論 / (読) せいたいこうぶんしかがくとくろん
形態 推奨
  1. 講義
コース 必須
  1. 2008/[環境創生工学専攻.生命テクノサイエンスコース]/[博士前期課程]
担当教員 必須
  1. 宇都 義浩([徳島大学.大学院社会産業理工学研究部.生物資源産業学域.応用生命系.応用生物資源学分野]/[徳島大学.生物資源産業学部.生物資源産業学科.応用生命講座])
    肩書 任意
  2. 堀 均
    肩書 任意
単位 必須 2
目的 必須

(英) The goal is to understand the structure and function of biological macromolecules from the perspective of molecular recognition and interaction.

(日) タンパク質や核酸などの生体高分子の立体構造と機能について,分子認識及び分子間相互作用を中心に理解する.

概要 必須

(英) How do biological macromolecules recognize the target molecule and function? An introduction to the basic structural biology and stereochemistry of biological macromolecules. Topics include protein and nucleic acid structure. Students should make presentations focusing the molecular recognition and interaction of biological macromolecules based on the PDB data and their recent scientific papers with molecular modeling software "MacroModel".

(日) 前半は,生体高分子がどのように基質やドラッグなどの標的分子を認識して作用するかについて,核酸やタンパク質と低分子に関する構造学,立体化学および反応機構について輪読形式にて概説する.後半は,分子モデリングとドラッグデザインについて概説した後,演習形式にてタンパク質データバンク(PDB)データベースから得られた立体構造について分子モデリングソフトウェア"MacroModel"を用いて解析する.

キーワード 推奨
  1. (英) molecular interaction / (日) 分子間相互作用
    データベース中に適合する可能性のある以下の情報を発見しました
    [キーワード] 分子間相互作用 (intermolecular interactions)
  2. (英) molecular recognition / (日) 分子認識
    データベース中に適合する可能性のある以下の情報を発見しました
    [キーワード] 分子認識 (molecular recognition)
  3. (英) protein data bank / (日) タンパク質データバンク
  4. (英) molrecular modeling / (日) 分子モデリング
先行科目 推奨
  1. 分子機能工学([2008/[環境創生工学専攻.生命テクノサイエンスコース]/[博士前期課程]]/->授業概要[2007/分子機能工学])
    必要度 任意 0.500000
関連科目 推奨
  1. 細胞生理学特論([2008/[環境創生工学専攻.生命テクノサイエンスコース]/[博士前期課程]]/->授業概要[2007/細胞生理学特論])
    関連度 任意 0.500000
要件 任意

(英) To understand the organic chemistry, medicinal chemistry, and the enzyme engineering

(日) 学部教育における有機化学,創薬化学および酵素工学を理解していること.

注意 任意

(英) None

(日) なし

目標 必須
  1. (英) To understand the principle of structure and function of biological macromolecule.

    (日) 生体高分子の構造と機能の原理を理解する

  2. (英) To understand the mechanisms of molecular recognition of biological macromolecule through PDB database search and molecular modeling software.

    (日) タンパク質データバンクのデータベースと分子モデリングソフトウェアを活用し生体高分子の分子認識機構を理解する

計画 必須
  1. (英) Interactions involved in the drug-receptor complex 1: forces

    (日) 受容体タンパク質と低分子の相互作用(1):分子間に働く力学

  2. (英) Interactions involved in the drug-receptor complex 2: topology and stereochemistry

    (日) 受容体タンパク質と低分子の相互作用(2):トポロジーと立体化学

  3. (英) Mechanisms of enzyme catalysis 1: specificity

    (日) 酵素の触媒機構(1):特異性

  4. (英) Mechanisms of enzyme catalysis2: reaction mechanisms

    (日) 酵素の触媒機構(2):反応機構

  5. (英) Interactions involved in the DNA-drug complex 1: DNA structure and properties

    (日) 核酸と低分子の相互作用(1):DNAの構造と性質

  6. (英) Interactions involved in the DNA-drug complex 2: DNA interactive Agents

    (日) 核酸と低分子の相互作用(2): DNAに作用するドラッグ

  7. (英) Molecular modeling and drug design 1: computational chemistry

    (日) 分子モデリングとドラッグデザイン(1):コンピュータ化学

  8. (英) Molecular modeling and drug design 2: drug screening techniques

    (日) 分子モデリングとドラッグデザイン(2):ドラッグスクリーニング法

  9. (英) Molecular modeling and drug design 3: Introduction to MacroModel

    (日) 分子モデリングとドラッグデザイン(3): MacroModelの説明

  10. (英) Exercise 1: search for protein 3D structures from the PDB

    (日) 演習(1): PDBのタンパク質3D構造データの検索

  11. (英) Exercise 2: representation of protein 3D structures

    (日) 演習(2):タンパク質3D構造の表示

  12. (英) Exercise 3: structural change of small molecules

    (日) 演習(3):低分子の構造変換

  13. (英) Exercise 4: molecular modeling for small molecules

    (日) 演習(4):低分子の分子モデリング

  14. (英) Exercise 5: molecular modeling for proteins 1

    (日) 演習(5):タンパク質の分子モデリング(1)

  15. (英) Exercise 6: molecular modeling for proteins 2

    (日) 演習(6):タンパク質の分子モデリング(2)

  16. (英) Report

    (日) レポート

評価 必須

(英) Report 100%

(日) レポート(100%)で評価する.

再評価 必須
対象学生 任意 他学科学生も履修可能
教科書 必須
  1. (英) none

    (日) なし

参考資料 推奨
  1. (英) R. B. Silverman; The ORGANIC CHEMISTRY of DRUG DESIGN and DRUG ACTION, ELSEVIER

    (日) R. B. Silverman著「The ORGANIC CHEMISTRY of DRUG DESIGN and DRUG ACTION」ELSEVIER

  2. (英) T. L. Lemke, D. A. Williams, V. F. Roche, S. W. Zito; FOYE'S PRINCIPLES OF MEDICINAL CHEMISTRY, Lippincott Williams & Wilkins

    (日) T. L. Lemke, D. A. Williams, V. F. Roche, S. W. Zito著「FOYE'S PRINCIPLES OF MEDICINAL CHEMISTRY」Lippincott Williams & Wilkins

URL 任意
連絡先 推奨
  1. 宇都 義浩([徳島大学.大学院社会産業理工学研究部.生物資源産業学域.応用生命系.応用生物資源学分野]/[徳島大学.生物資源産業学部.生物資源産業学科.応用生命講座])
    オフィスアワー 任意
科目コード 推奨
備考 任意

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