徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

Education and Research Database (EDB), Tokushima University

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著作: Shaheduzzaman Mohammed Syed/Akimoto Shigeru/[桑原 知巳]/Kinouchi Takemi/Ohnishi Yoshinari/Genome Analysis of Bacteroides by Pulsed-field Gel Electrophoresis: Chromosome Sizes and Restriction Patterns/[DNA Research]

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EID
136769
EOID
656962
Map
0
LastModified
2012年9月2日(日) 18:46:27
Operator
大家 隆弘
Avail
TRUE
Censor
0
Owner
[副研究部長]/[徳島大学.大学院ヘルスバイオサイエンス研究部]
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. (英) Shaheduzzaman Mohammed Syed
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Akimoto Shigeru
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. 桑原 知巳
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Kinouchi Takemi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. (英) Ohnishi Yoshinari
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Genome Analysis of Bacteroides by Pulsed-field Gel Electrophoresis: Chromosome Sizes and Restriction Patterns

副題 任意
要約 任意

(英) The chromosomal DNAs of nine strains of seven Bacteroides species including B. fragilis, the type species of the genus Bacteroides, were digested with rare-cutting restriction enzymes I-Ceu I, Not I, and Asc I and analysed by pulsed-field gel electrophoresis. The genome sizes of B. fragilis, B. distasonis, B. eggerthii, B. ovatus, B. thetaiotaomicron, B. uniformis, and B. vulgatus were determined to be 5.3, 4.8, 4.4, 6.9, 4.8, 4.6, and 5.1 Mbp, respectively. B. distasonis and B. vulgatus, and also B. uniformis and B. eggerthii, showed similar I-Ceu I restriction profiles. I-Ceu I cut B. uniformis and B. eggerthii genomes into four, B. ovatus into five, B. fragilis and B. thetaiotaomicron into six, and B. distasonis and B. vulgatus into seven fragments. On the basis of genome size, restriction profile, and I-Ceu I fragment number, a phylogenetic tree of the Bacteroides species was proposed. This was in overall agreement with the previous phylogenetic tree obtained by 16S rRNA data, with the exceptions of B. distasonis and B. ovatus.

キーワード 推奨
  1. (英) Bacteroides species
  2. (英) PFGE
  3. (英) genome size
  4. (英) restriction pattern
  5. (英) phylogenetic relationship
発行所 推奨 (英) Kazusa DNA Research Institute
誌名 必須 DNA Research([Oxford University Press])
(pISSN: 1340-2838, eISSN: 1756-1663)
ISSN 任意 1340-2838
ISSN: 1340-2838 (pISSN: 1340-2838, eISSN: 1756-1663)
Title: DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes
Title(ISO): DNA Res
Publisher: Oxford University Press
 (NLM Catalog  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 4
必須 1
必須 19 25
都市 任意
年月日 必須 1997年 2月 28日
URL 任意
DOI 任意 10.1093/dnares/4.1.19    (→Scopusで検索)
PMID 任意 9179492    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意
Scopus 任意
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.Affiliation: Department of Bacteriology, School of Medicine, University of Tokushima, Japan.

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Comparative Study

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article