徳島大学 教育・研究者情報データベース(EDB)

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著作: [桑原 知巳]/Norimatsu Izumi/[中山 治之]/Akimoto Shigeru/[片岡 佳子]/[有持 秀喜]/[大西 克成]/Genetic variation in 16S-23S rDNA internal transcribed spacer regions and the possible use of this genetic variation for molecular diagnosis of Bacteroides species/[Microbiology and Immunology]

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EID
127936
EOID
730029
Map
0
LastModified
2014年4月11日(金) 11:02:47
Operator
松井 栄里
Avail
TRUE
Censor
0
Owner
片岡 佳子
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種別 必須 学術論文(審査論文)
言語 必須 英語
招待 推奨
審査 推奨
カテゴリ 推奨
共著種別 推奨
学究種別 推奨
組織 推奨
著者 必須
  1. 桑原 知巳
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  2. (英) Norimatsu Izumi
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  3. 中山 治之
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  4. (英) Akimoto Shigeru
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  5. 片岡 佳子([徳島大学.大学院医歯薬学研究部.保健学域.保健科学部門.医用検査学系.微生物・遺伝子解析学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  6. 有持 秀喜([徳島大学.大学院医歯薬学研究部.医学域.医科学部門.病理系.生体防御医学])
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
  7. 大西 克成
    役割 任意
    貢献度 任意
    学籍番号 推奨
題名 必須

(英) Genetic variation in 16S-23S rDNA internal transcribed spacer regions and the possible use of this genetic variation for molecular diagnosis of Bacteroides species

副題 任意
要約 任意

(英) The structural variation in 16S-23S rDNA internal transcribed spacer regions (ITS) among Bacteroides species was assessed by PCR amplification and sequencing analysis, and its possible use for molecular diagnosis of these species was evaluated. Ninety strains of the genus Bacteroides, including the species B. distasonis, B. eggerthii, B. fragilis, B. ovatus, B. thetaiotaomicron, B. uniformis and B. vulgatus, produced one to three ITS amplification products with sizes ranging from 615 to 810 bp. Some Bacteroides strains could be differentiated at species level on the basis of ITS amplification patterns and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis using a four-nucleotide-recognizing enzyme, Msp I. The results of sequence analysis of ITS amplification products revealed genes for Ile-tRNA and Ala-tRNA in all strains tested. The nucleotide sequence, except for that in tRNA-coding regions, was highly variable and characteristic for each species, but a common sequence among B. fragilis, B. thetaiotaomicron and B. ovatus was observed. A digoxigenin-labeled oligonucleotide probe (named FOT1), which was designed from this conserved sequence, specifically hybridized to the ITS amplification products from B. fragilis, B. thetaiotaomicron and B. ovatus. These results suggest that the ITS region is a useful target for the development of rapid and accurate techniques for identification of Bacteroides species.

キーワード 推奨
  1. (英) Bacteroides
  2. (英) 16S-23S rDNA spacer
  3. (英) Molecular diagnosis
発行所 推奨 (日) 日本細菌学会,日本ウィルス学会,日本免疫学会 / (読) にほんさいきんがっかい にほんうぃるすがっかい にほんめんえきがっかい
誌名 必須 Microbiology and Immunology([日本細菌学会])
(pISSN: 0385-5600, eISSN: 1348-0421)
ISSN 任意 0385-5600
ISSN: 0385-5600 (pISSN: 0385-5600, eISSN: 1348-0421)
Title: Microbiology and immunology
Title(ISO): Microbiol Immunol
Supplier: 財団法人 学会誌刊行センター
Publisher: Wiley Publishing
 (NLM Catalog  (医中誌Web  (J-STAGE  (Wiley  (Scopus  (CrossRef (Scopus information is found. [need login])
必須 45
必須 3
必須 191 199
都市 任意
年月日 必須 2001年 0月 初日
URL 任意
DOI 任意
PMID 任意 11345528    (→Scopusで検索)
NAID 任意
WOS 任意 000167322800001
Scopus 任意 2-s2.0-0035066982
評価値 任意
被引用数 任意
指導教員 推奨
備考 任意
  1. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Comparative Study

  2. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Journal Article

  3. (英) Article.PublicationTypeList.PublicationType: Research Support, Non-U.S. Gov't